Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.499e-8■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RACK1-230ENST00000513060 1651 ntTSL 515.76■□□□□ 0.113e-42■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.343e-42■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RACK1-224ENST00000511473 1150 ntTSL 511.99□□□□□ -0.493e-42■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-42■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.53e-42■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RACK1-219ENST00000508682 1208 ntTSL 511.66□□□□□ -0.543e-42■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RACK1-210ENST00000504325 1098 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.643e-42■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-42■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.83e-42■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.814e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.544e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.51e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 GNB1L-204ENST00000453108 702 ntTSL 324.06■■□□□ 1.441e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.362e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.324e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.34e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 INO80E-212ENST00000568043 482 ntTSL 222.51■■□□□ 1.191e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.174e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ITGB3BP-212ENST00000489099 1285 ntTSL 1 (best)21.3■■□□□ 12e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.884e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 PRPF31-207ENST00000466404 1837 ntTSL 220.38■□□□□ 0.852e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.772e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.732e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.74e-6■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 INO80E-202ENST00000380503 435 ntTSL 219.28■□□□□ 0.681e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 INO80E-206ENST00000563040 563 ntTSL 319.28■□□□□ 0.681e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LSM1-204ENST00000522515 1568 ntTSL 318.89■□□□□ 0.622e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.572e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RELA-220ENST00000532999 1341 ntTSL 516.99■□□□□ 0.316e-17■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-12■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.164e-12■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SGTA-205ENST00000591984 882 ntTSL 213.84□□□□□ -0.192e-13■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.284e-12■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DAB2-202ENST00000339788 3690 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.51e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TXNRD1-217ENST00000527688 3858 ntTSL 211.51□□□□□ -0.574e-12■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 511.45□□□□□ -0.581e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DES-203ENST00000483395 462 ntTSL 211.15□□□□□ -0.622e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 MARF1-215ENST00000552771 4157 ntTSL 211.08□□□□□ -0.642e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SELENOT-207ENST00000615547 3488 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.656e-17■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DAB2-217ENST00000545653 4537 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DAB2-201ENST00000320816 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SUB1-209ENST00000511615 1658 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.752e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.84e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ITGB3BP-202ENST00000371092 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.842e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.851e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.966e-17■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ITGB3BP-214ENST00000492655 589 ntTSL 28.88□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ITGB3BP-205ENST00000461681 1096 ntTSL 38.86□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DCTN5-203ENST00000563614 3405 nt8.65□□□□□ -1.022e-9■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SPTBN1-204ENST00000467371 3332 ntTSL 28.54□□□□□ -1.044e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.052e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.052e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.072e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.092e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LINC01088-206ENST00000510667 534 ntTSL 38.23□□□□□ -1.092e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.112e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TRRAP-205ENST00000456197 11654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.05□□□□□ -1.122e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LINC01088-209ENST00000512130 525 ntTSL 38.02□□□□□ -1.132e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.142e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 C9-203ENST00000483232 560 ntTSL 47.88□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.162e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.214e-12■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.244e-12■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.244e-12■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.252e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.252e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.272e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-9■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 SOCS2-211ENST00000551883 719 ntTSL 26.93□□□□□ -1.31e-10■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TMEM126B-203ENST00000526822 853 ntTSL 26.88□□□□□ -1.312e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.312e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.322e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.382e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TMEM126B-205ENST00000529197 1149 ntTSL 1 (best)6.24□□□□□ -1.412e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LINC01088-211ENST00000515597 664 ntTSL 1 (best)5.82□□□□□ -1.482e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LINC01088-210ENST00000513153 695 ntTSL 35.55□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 LINC01088-204ENST00000507761 842 ntTSL 25.4□□□□□ -1.542e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.772e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.922e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TAL1-203ENST00000459729 1796 ntTSL 1 (best)27.03■■□□□ 1.921e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.851e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.261e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.381e-7■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 217.87■□□□□ 0.452e-6■□□□□ 10.4
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