RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.51■■■■■ 5.04
INO80E-212ENST00000568043 ABCC9O60706 1549 aa42.37■■■■■ 4.37
INO80E-212ENST00000568043 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.9■■■■■ 4.3
INO80E-212ENST00000568043 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.25■■■■■ 4.03
INO80E-212ENST00000568043 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.07■■■■■ 4.01
INO80E-212ENST00000568043 NACADO15069 1562 aa39.7■■■■□ 3.95
INO80E-212ENST00000568043 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.4■■■■□ 3.9
INO80E-212ENST00000568043 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
INO80E-212ENST00000568043 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.34■■■■□ 3.89
INO80E-212ENST00000568043 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.05■■■■□ 3.84
INO80E-212ENST00000568043 MYO15BQ96JP2 1530 aa39■■■■□ 3.83
INO80E-212ENST00000568043 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
INO80E-212ENST00000568043 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.35■■■■□ 3.73
INO80E-212ENST00000568043 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.29■■■■□ 3.72
INO80E-212ENST00000568043 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.27■■■■□ 3.72
INO80E-212ENST00000568043 SCRIBQ14160 1630 aa38.19■■■■□ 3.7
INO80E-212ENST00000568043 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.18■■■■□ 3.7
INO80E-212ENST00000568043 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
INO80E-212ENST00000568043 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.18■■■■□ 3.54
INO80E-212ENST00000568043 NCAPD3P42695 1498 aa36.69■■■■□ 3.46
INO80E-212ENST00000568043 CUX2O14529 1486 aa36.63■■■■□ 3.45
INO80E-212ENST00000568043 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.53■■■■□ 3.44
INO80E-212ENST00000568043 ERCC6Q03468 1493 aa36.52■■■■□ 3.44
INO80E-212ENST00000568043 SMARCA4P51532 1647 aa36.39■■■■□ 3.42
INO80E-212ENST00000568043 HMGXB3Q12766 1538 aa36.35■■■■□ 3.41
INO80E-212ENST00000568043 SMARCA2P51531 1590 aa36.34■■■■□ 3.41
INO80E-212ENST00000568043 NESP48681 1621 aa36.33■■■■□ 3.41
INO80E-212ENST00000568043 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
INO80E-212ENST00000568043 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
INO80E-212ENST00000568043 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.03■■■■□ 3.36
INO80E-212ENST00000568043 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
INO80E-212ENST00000568043 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.9■■■■□ 3.34
INO80E-212ENST00000568043 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.88■■■■□ 3.33
INO80E-212ENST00000568043 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.84■■■■□ 3.33
INO80E-212ENST00000568043 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.67■■■■□ 3.3
INO80E-212ENST00000568043 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.53■■■■□ 3.28
INO80E-212ENST00000568043 WIZO95785 1651 aa35.44■■■■□ 3.26
INO80E-212ENST00000568043 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.43■■■■□ 3.26
INO80E-212ENST00000568043 WDR62O43379 1518 aa35.39■■■■□ 3.26
INO80E-212ENST00000568043 TRIM41Q8WV44 630 aa35.34■■■■□ 3.25
INO80E-212ENST00000568043 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.19■■■■□ 3.22
INO80E-212ENST00000568043 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.14■■■■□ 3.22
INO80E-212ENST00000568043 CFTRP13569 1480 aa35.06■■■■□ 3.2
INO80E-212ENST00000568043 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
INO80E-212ENST00000568043 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
INO80E-212ENST00000568043 OSCARQ8IYS5 282 aa34.89■■■■□ 3.18
INO80E-212ENST00000568043 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
INO80E-212ENST00000568043 PRDM2Q13029 1718 aa34.7■■■■□ 3.15
INO80E-212ENST00000568043 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
INO80E-212ENST00000568043 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.56■■■■□ 3.12
INO80E-212ENST00000568043 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.56■■■■□ 3.12
INO80E-212ENST00000568043 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.56■■■■□ 3.12
INO80E-212ENST00000568043 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.53■■■■□ 3.12
INO80E-212ENST00000568043 IFT140Q96RY7 1462 aa34.49■■■■□ 3.11
INO80E-212ENST00000568043 TOPBP1Q92547 1522 aa34.45■■■■□ 3.1
INO80E-212ENST00000568043 ARHGEF11O15085 1522 aa34.38■■■■□ 3.09
INO80E-212ENST00000568043 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.09
INO80E-212ENST00000568043 ABCC8Q09428 1581 aa34.25■■■■□ 3.07
INO80E-212ENST00000568043 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.25■■■■□ 3.07
INO80E-212ENST00000568043 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
INO80E-212ENST00000568043 CHD1O14646 1710 aa34.21■■■■□ 3.07
INO80E-212ENST00000568043 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.2■■■■□ 3.06
INO80E-212ENST00000568043 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.14■■■■□ 3.06
INO80E-212ENST00000568043 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
INO80E-212ENST00000568043 ARAP1Q96P48 1450 aa34.04■■■■□ 3.04
INO80E-212ENST00000568043 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.98■■■■□ 3.03
INO80E-212ENST00000568043 FBLN2P98095 1184 aa33.97■■■■□ 3.03
INO80E-212ENST00000568043 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
INO80E-212ENST00000568043 SOGA1O94964 1423 aa33.87■■■■□ 3.01
INO80E-212ENST00000568043 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
INO80E-212ENST00000568043 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.8■■■■□ 3
INO80E-212ENST00000568043 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.78■■■■□ 3
INO80E-212ENST00000568043 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.77■■■■□ 3
INO80E-212ENST00000568043 CUX1P39880 1505 aa33.73■■■□□ 2.99
INO80E-212ENST00000568043 WDR97A6NE52 1622 aa33.71■■■□□ 2.99
INO80E-212ENST00000568043 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
INO80E-212ENST00000568043 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
INO80E-212ENST00000568043 SYNJ1O43426 1573 aa33.63■■■□□ 2.97
INO80E-212ENST00000568043 GRIN2BQ13224 1484 aa33.61■■■□□ 2.97
INO80E-212ENST00000568043 SYNJ2O15056 1496 aa33.56■■■□□ 2.96
INO80E-212ENST00000568043 PBRM1Q86U86 1689 aa33.52■■■□□ 2.96
INO80E-212ENST00000568043 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.46■■■□□ 2.95
INO80E-212ENST00000568043 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.39■■■□□ 2.93
INO80E-212ENST00000568043 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.36■■■□□ 2.93
INO80E-212ENST00000568043 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.28■■■□□ 2.92
INO80E-212ENST00000568043 GRIN2AQ12879 1464 aa33.21■■■□□ 2.91
INO80E-212ENST00000568043 CEP170Q5SW79 1584 aa33.16■■■□□ 2.9
INO80E-212ENST00000568043 ADAMTS12P58397 1594 aa33.14■■■□□ 2.9
INO80E-212ENST00000568043 NUP160Q12769 1436 aa33.13■■■□□ 2.89
INO80E-212ENST00000568043 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
INO80E-212ENST00000568043 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.1■■■□□ 2.89
INO80E-212ENST00000568043 SHROOM2Q13796 1616 aa33.06■■■□□ 2.88
INO80E-212ENST00000568043 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.05■■■□□ 2.88
INO80E-212ENST00000568043 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
INO80E-212ENST00000568043 TOP2BQ02880 1626 aa33.02■■■□□ 2.88
INO80E-212ENST00000568043 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.99■■■□□ 2.87
INO80E-212ENST00000568043 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.92■■■□□ 2.86
INO80E-212ENST00000568043 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.91■■■□□ 2.86
INO80E-212ENST00000568043 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
INO80E-212ENST00000568043 JPH4Q96JJ6 628 aa32.77■■■□□ 2.84
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