Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TBC1D9B-216ENST00000522224 532 ntTSL 517.43■□□□□ 0.389e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.389e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DOT1L-207ENST00000586024 725 ntTSL 317.35■□□□□ 0.379e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ARFGAP1-204ENST00000395285 2697 ntTSL 217.24■□□□□ 0.359e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.329e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 FANCA-206ENST00000561660 762 ntTSL 517.05■□□□□ 0.329e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-204ENST00000563088 1067 ntTSL 317.05■□□□□ 0.329e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ARFGAP1-207ENST00000518618 1244 ntTSL 217.01■□□□□ 0.319e-6■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 RSAD1-202ENST00000443328 1044 ntTSL 216.78■□□□□ 0.289e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.259e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.199e-6■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.19e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-210ENST00000465166 702 ntTSL 215.6■□□□□ 0.099e-6■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.017e-9■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RSAD1-206ENST00000510554 554 ntTSL 415.07■□□□□ 09e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -09e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PSMD13-202ENST00000382671 1489 ntTSL 1 (best)15.02■□□□□ -09e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -09e-6■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 514.82□□□□□ -0.049e-6■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 STX16-206ENST00000371132 4552 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.731e-30■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RXRB-203ENST00000481441 1330 ntTSL 216.45■□□□□ 0.222e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 SLC12A4-213ENST00000573702 633 ntTSL 413.62□□□□□ -0.236e-8■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RNF31-219ENST00000559882 554 ntTSL 421.57■■□□□ 1.042e-11■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RNF31-210ENST00000559260 551 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-11■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ABCC3-212ENST00000513511 1042 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ABCC3-207ENST00000505699 5271 ntTSL 212.84□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ABCC3-203ENST00000502426 5326 ntTSL 212.83□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 NUDC-203ENST00000452707 816 ntTSL 321.3■■□□□ 15e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AMDHD2-207ENST00000563453 555 ntTSL 216.37■□□□□ 0.215e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.27e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.457e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 213.54□□□□□ -0.247e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 INF2-208ENST00000481338 1102 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 INF2-201ENST00000252527 3050 ntTSL 214.74□□□□□ -0.053e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 SRRM2-226ENST00000576415 461 ntTSL 224.58■■□□□ 1.534e-15■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SRRM2-223ENST00000575701 860 ntTSL 324.14■■□□□ 1.454e-15■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SRRM2-219ENST00000574340 579 ntTSL 318.58■□□□□ 0.564e-15■□□□□ 8.1
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