RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484894.5

POLR2F-210, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 4

Gene POLR2F, Length 551 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-210ENST00000484894 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.81■■■■□ 3
POLR2F-210ENST00000484894 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.18■■■□□ 2.42
POLR2F-210ENST00000484894 ABCC9O60706 1549 aa29.38■■■□□ 2.29
POLR2F-210ENST00000484894 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.33■■■□□ 2.13
POLR2F-210ENST00000484894 NACADO15069 1562 aa28.29■■■□□ 2.12
POLR2F-210ENST00000484894 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
POLR2F-210ENST00000484894 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.13■■■□□ 2.09
POLR2F-210ENST00000484894 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.11■■■□□ 2.09
POLR2F-210ENST00000484894 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28■■■□□ 2.07
POLR2F-210ENST00000484894 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.83■■■□□ 2.05
POLR2F-210ENST00000484894 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.48■■□□□ 1.99
POLR2F-210ENST00000484894 SCRIBQ14160 1630 aa27.45■■□□□ 1.99
POLR2F-210ENST00000484894 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
POLR2F-210ENST00000484894 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.19■■□□□ 1.94
POLR2F-210ENST00000484894 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.1■■□□□ 1.93
POLR2F-210ENST00000484894 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
POLR2F-210ENST00000484894 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.65■■□□□ 1.86
POLR2F-210ENST00000484894 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.41■■□□□ 1.82
POLR2F-210ENST00000484894 SMARCA4P51532 1647 aa26.28■■□□□ 1.8
POLR2F-210ENST00000484894 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
POLR2F-210ENST00000484894 SMARCA2P51531 1590 aa26.08■■□□□ 1.77
POLR2F-210ENST00000484894 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.07■■□□□ 1.76
POLR2F-210ENST00000484894 NCAPD3P42695 1498 aa26.05■■□□□ 1.76
POLR2F-210ENST00000484894 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-210ENST00000484894 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-210ENST00000484894 HMGXB3Q12766 1538 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-210ENST00000484894 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
POLR2F-210ENST00000484894 WIZO95785 1651 aa25.82■■□□□ 1.72
POLR2F-210ENST00000484894 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
POLR2F-210ENST00000484894 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
POLR2F-210ENST00000484894 NESP48681 1621 aa25.43■■□□□ 1.66
POLR2F-210ENST00000484894 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.43■■□□□ 1.66
POLR2F-210ENST00000484894 ERCC6Q03468 1493 aa25.33■■□□□ 1.65
POLR2F-210ENST00000484894 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.27■■□□□ 1.64
POLR2F-210ENST00000484894 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.26■■□□□ 1.63
POLR2F-210ENST00000484894 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.19■■□□□ 1.62
POLR2F-210ENST00000484894 PRDM2Q13029 1718 aa25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-210ENST00000484894 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.17■■□□□ 1.62
POLR2F-210ENST00000484894 CFTRP13569 1480 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR2F-210ENST00000484894 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
POLR2F-210ENST00000484894 CUX2O14529 1486 aa25.09■■□□□ 1.61
POLR2F-210ENST00000484894 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.01■■□□□ 1.59
POLR2F-210ENST00000484894 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.99■■□□□ 1.59
POLR2F-210ENST00000484894 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
POLR2F-210ENST00000484894 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.96■■□□□ 1.59
POLR2F-210ENST00000484894 WDR62O43379 1518 aa24.91■■□□□ 1.58
POLR2F-210ENST00000484894 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.79■■□□□ 1.56
POLR2F-210ENST00000484894 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
POLR2F-210ENST00000484894 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.63■■□□□ 1.53
POLR2F-210ENST00000484894 TOPBP1Q92547 1522 aa24.63■■□□□ 1.53
POLR2F-210ENST00000484894 ABCC8Q09428 1581 aa24.63■■□□□ 1.53
POLR2F-210ENST00000484894 IFT140Q96RY7 1462 aa24.46■■□□□ 1.51
POLR2F-210ENST00000484894 CUX1P39880 1505 aa24.45■■□□□ 1.5
POLR2F-210ENST00000484894 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
POLR2F-210ENST00000484894 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
POLR2F-210ENST00000484894 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.36■■□□□ 1.49
POLR2F-210ENST00000484894 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
POLR2F-210ENST00000484894 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
POLR2F-210ENST00000484894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.31■■□□□ 1.48
POLR2F-210ENST00000484894 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.28■■□□□ 1.48
POLR2F-210ENST00000484894 WDR97A6NE52 1622 aa24.27■■□□□ 1.48
POLR2F-210ENST00000484894 TOP2BQ02880 1626 aa24.27■■□□□ 1.48
POLR2F-210ENST00000484894 SOGA1O94964 1423 aa24.27■■□□□ 1.48
POLR2F-210ENST00000484894 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
POLR2F-210ENST00000484894 SYNJ1O43426 1573 aa24.25■■□□□ 1.47
POLR2F-210ENST00000484894 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.465e-7■■■■■ 39.8
POLR2F-210ENST00000484894 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.13■■□□□ 1.45
POLR2F-210ENST00000484894 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
POLR2F-210ENST00000484894 PBRM1Q86U86 1689 aa24.1■■□□□ 1.45
POLR2F-210ENST00000484894 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.09■■□□□ 1.45
POLR2F-210ENST00000484894 CHD1O14646 1710 aa24.07■■□□□ 1.44
POLR2F-210ENST00000484894 GRIN2BQ13224 1484 aa24.01■■□□□ 1.43
POLR2F-210ENST00000484894 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.01■■□□□ 1.43
POLR2F-210ENST00000484894 OSCARQ8IYS5 282 aa23.99■■□□□ 1.43
POLR2F-210ENST00000484894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.99■■□□□ 1.43
POLR2F-210ENST00000484894 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
POLR2F-210ENST00000484894 TRIM41Q8WV44 630 aa23.9■■□□□ 1.42
POLR2F-210ENST00000484894 SYNJ2O15056 1496 aa23.87■■□□□ 1.41
POLR2F-210ENST00000484894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.85■■□□□ 1.41
POLR2F-210ENST00000484894 ADAMTS12P58397 1594 aa23.84■■□□□ 1.41
POLR2F-210ENST00000484894 FBLN2P98095 1184 aa23.84■■□□□ 1.41
POLR2F-210ENST00000484894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
POLR2F-210ENST00000484894 KIF27Q86VH2 1401 aa23.74■■□□□ 1.39
POLR2F-210ENST00000484894 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.74■■□□□ 1.39
POLR2F-210ENST00000484894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.73■■□□□ 1.39
POLR2F-210ENST00000484894 GRIN2AQ12879 1464 aa23.72■■□□□ 1.39
POLR2F-210ENST00000484894 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.7■■□□□ 1.39
POLR2F-210ENST00000484894 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.7■■□□□ 1.39
POLR2F-210ENST00000484894 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.7■■□□□ 1.39
POLR2F-210ENST00000484894 CUL7Q14999 1698 aa23.7■■□□□ 1.38
POLR2F-210ENST00000484894 ARHGEF11O15085 1522 aa23.66■■□□□ 1.38
POLR2F-210ENST00000484894 CEP170Q5SW79 1584 aa23.64■■□□□ 1.37
POLR2F-210ENST00000484894 IGF1RP08069 1367 aa23.62■■□□□ 1.37
POLR2F-210ENST00000484894 NUP160Q12769 1436 aa23.61■■□□□ 1.37
POLR2F-210ENST00000484894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.53■■□□□ 1.36
POLR2F-210ENST00000484894 SHROOM2Q13796 1616 aa23.51■■□□□ 1.35
POLR2F-210ENST00000484894 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.48■■□□□ 1.35
POLR2F-210ENST00000484894 ARAP1Q96P48 1450 aa23.46■■□□□ 1.35
POLR2F-210ENST00000484894 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.42■■□□□ 1.34
POLR2F-210ENST00000484894 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms