RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522224.3

TBC1D9B-216, Transcript of TBC1 domain family member 9B, humanhuman

TSL 5

Gene TBC1D9B, Length 532 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9B-216ENST00000522224 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.05■■■■■ 4.8
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TBC1D9B-216ENST00000522224 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.53■■■■□ 3.6
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TBC1D9B-216ENST00000522224 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.07■■■■□ 3.36
TBC1D9B-216ENST00000522224 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.96■■■■□ 3.35
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TBC1D9B-216ENST00000522224 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.01■■■■□ 3.19
TBC1D9B-216ENST00000522224 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
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TBC1D9B-216ENST00000522224 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.72■■■■□ 3.15
TBC1D9B-216ENST00000522224 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.66■■■■□ 3.14
TBC1D9B-216ENST00000522224 ERCC6Q03468 1493 aa34.52■■■■□ 3.12
TBC1D9B-216ENST00000522224 NESP48681 1621 aa34.41■■■■□ 3.1
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TBC1D9B-216ENST00000522224 CUX2O14529 1486 aa34.26■■■■□ 3.07
TBC1D9B-216ENST00000522224 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.22■■■■□ 3.07
TBC1D9B-216ENST00000522224 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.2■■■■□ 3.07
TBC1D9B-216ENST00000522224 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
TBC1D9B-216ENST00000522224 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.05■■■■□ 3.04
TBC1D9B-216ENST00000522224 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.05■■■■□ 3.04
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TBC1D9B-216ENST00000522224 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.93■■■■□ 3.02
TBC1D9B-216ENST00000522224 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
TBC1D9B-216ENST00000522224 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.71■■■□□ 2.99
TBC1D9B-216ENST00000522224 CFTRP13569 1480 aa33.7■■■□□ 2.99
TBC1D9B-216ENST00000522224 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.67■■■□□ 2.98
TBC1D9B-216ENST00000522224 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.66■■■□□ 2.98
TBC1D9B-216ENST00000522224 WDR62O43379 1518 aa33.58■■■□□ 2.97
TBC1D9B-216ENST00000522224 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.55■■■□□ 2.96
TBC1D9B-216ENST00000522224 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
TBC1D9B-216ENST00000522224 PRDM2Q13029 1718 aa33.3■■■□□ 2.92
TBC1D9B-216ENST00000522224 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 TOPBP1Q92547 1522 aa33.04■■■□□ 2.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 ABCC8Q09428 1581 aa33■■■□□ 2.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 IFT140Q96RY7 1462 aa32.97■■■□□ 2.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.95■■■□□ 2.86
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
TBC1D9B-216ENST00000522224 OSCARQ8IYS5 282 aa32.82■■■□□ 2.84
TBC1D9B-216ENST00000522224 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
TBC1D9B-216ENST00000522224 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.82
TBC1D9B-216ENST00000522224 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
TBC1D9B-216ENST00000522224 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.66■■■□□ 2.829e-7■■■■□ 20
TBC1D9B-216ENST00000522224 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.63■■■□□ 2.81
TBC1D9B-216ENST00000522224 SOGA1O94964 1423 aa32.63■■■□□ 2.81
TBC1D9B-216ENST00000522224 TRIM41Q8WV44 630 aa32.62■■■□□ 2.81
TBC1D9B-216ENST00000522224 CUX1P39880 1505 aa32.6■■■□□ 2.81
TBC1D9B-216ENST00000522224 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.6■■■□□ 2.81
TBC1D9B-216ENST00000522224 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
TBC1D9B-216ENST00000522224 FBLN2P98095 1184 aa32.47■■■□□ 2.79
TBC1D9B-216ENST00000522224 WDR97A6NE52 1622 aa32.37■■■□□ 2.77
TBC1D9B-216ENST00000522224 CHD1O14646 1710 aa32.34■■■□□ 2.77
TBC1D9B-216ENST00000522224 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.32■■■□□ 2.76
TBC1D9B-216ENST00000522224 GRIN2BQ13224 1484 aa32.29■■■□□ 2.76
TBC1D9B-216ENST00000522224 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.27■■■□□ 2.76
TBC1D9B-216ENST00000522224 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.27■■■□□ 2.76
TBC1D9B-216ENST00000522224 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.27■■■□□ 2.76
TBC1D9B-216ENST00000522224 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
TBC1D9B-216ENST00000522224 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.75
TBC1D9B-216ENST00000522224 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
TBC1D9B-216ENST00000522224 ARHGEF11O15085 1522 aa32.23■■■□□ 2.75
TBC1D9B-216ENST00000522224 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.23■■■□□ 2.75
TBC1D9B-216ENST00000522224 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.22■■■□□ 2.75
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TBC1D9B-216ENST00000522224 SYNJ1O43426 1573 aa32.15■■■□□ 2.74
TBC1D9B-216ENST00000522224 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.14■■■□□ 2.74
TBC1D9B-216ENST00000522224 SYNJ2O15056 1496 aa32.13■■■□□ 2.73
TBC1D9B-216ENST00000522224 PBRM1Q86U86 1689 aa32.12■■■□□ 2.73
TBC1D9B-216ENST00000522224 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.11■■■□□ 2.73
TBC1D9B-216ENST00000522224 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.06■■■□□ 2.72
TBC1D9B-216ENST00000522224 CLASP1Q7Z460 1538 aa32■■■□□ 2.71
TBC1D9B-216ENST00000522224 ARAP1Q96P48 1450 aa31.93■■■□□ 2.7
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TBC1D9B-216ENST00000522224 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.83■■■□□ 2.69
TBC1D9B-216ENST00000522224 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.82■■■□□ 2.68
TBC1D9B-216ENST00000522224 NUP160Q12769 1436 aa31.71■■■□□ 2.67
TBC1D9B-216ENST00000522224 CEP170Q5SW79 1584 aa31.71■■■□□ 2.67
TBC1D9B-216ENST00000522224 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
TBC1D9B-216ENST00000522224 KIF27Q86VH2 1401 aa31.62■■■□□ 2.65
TBC1D9B-216ENST00000522224 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.55■■■□□ 2.64
TBC1D9B-216ENST00000522224 IGF1RP08069 1367 aa31.54■■■□□ 2.64
TBC1D9B-216ENST00000522224 SHROOM2Q13796 1616 aa31.49■■■□□ 2.63
TBC1D9B-216ENST00000522224 JPH4Q96JJ6 628 aa31.46■■■□□ 2.63
TBC1D9B-216ENST00000522224 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
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