RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481338.1

INF2-208, Transcript of inverted formin, FH2 and WH2 domain containing, human

TSL 2

Gene INF2, Length 1,102 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
INF2-208	ENST00000481338	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.83	■■■■■ 4.61
INF2-208	ENST00000481338	ABCC9	O60706	1549 aa		39.6	■■■■□ 3.93
INF2-208	ENST00000481338	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.44	■■■■□ 3.9
INF2-208	ENST00000481338	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.58	■■■■□ 3.61
INF2-208	ENST00000481338	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.46	■■■■□ 3.59
INF2-208	ENST00000481338	NACAD	O15069	1562 aa		37.29	■■■■□ 3.56
INF2-208	ENST00000481338	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.87	■■■■□ 3.49
INF2-208	ENST00000481338	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.79	■■■■□ 3.48
INF2-208	ENST00000481338	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.77	■■■■□ 3.48	1e-6	■■■■□ 19.9
INF2-208	ENST00000481338	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.75	■■■■□ 3.47
INF2-208	ENST00000481338	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.68	■■■■□ 3.46
INF2-208	ENST00000481338	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.33	■■■■□ 3.41
INF2-208	ENST00000481338	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.23	■■■■□ 3.39
INF2-208	ENST00000481338	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.05	■■■■□ 3.36
INF2-208	ENST00000481338	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.88	■■■■□ 3.33
INF2-208	ENST00000481338	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.81	■■■■□ 3.32
INF2-208	ENST00000481338	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.69	■■■■□ 3.3
INF2-208	ENST00000481338	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.68	■■■■□ 3.3
INF2-208	ENST00000481338	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.47	■■■■□ 3.11
INF2-208	ENST00000481338	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.44	■■■■□ 3.1
INF2-208	ENST00000481338	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.34	■■■■□ 3.09
INF2-208	ENST00000481338	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.26	■■■■□ 3.07
INF2-208	ENST00000481338	CUX2	O14529	1486 aa		34.23	■■■■□ 3.07
INF2-208	ENST00000481338	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.21	■■■■□ 3.07
INF2-208	ENST00000481338	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.16	■■■■□ 3.06
INF2-208	ENST00000481338	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.08	■■■■□ 3.05
INF2-208	ENST00000481338	NES	P48681	1621 aa		34.03	■■■■□ 3.04
INF2-208	ENST00000481338	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.98	■■■■□ 3.03
INF2-208	ENST00000481338	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.98	■■■■□ 3.03
INF2-208	ENST00000481338	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
INF2-208	ENST00000481338	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.81	■■■■□ 3
INF2-208	ENST00000481338	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
INF2-208	ENST00000481338	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.69	■■■□□ 2.98
INF2-208	ENST00000481338	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.57	■■■□□ 2.96
INF2-208	ENST00000481338	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.41	■■■□□ 2.94
INF2-208	ENST00000481338	WIZ	O95785	1651 aa		33.36	■■■□□ 2.93
INF2-208	ENST00000481338	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.35	■■■□□ 2.93
INF2-208	ENST00000481338	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.23	■■■□□ 2.91
INF2-208	ENST00000481338	WDR62	O43379	1518 aa		33.23	■■■□□ 2.91
INF2-208	ENST00000481338	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.01	■■■□□ 2.88
INF2-208	ENST00000481338	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
INF2-208	ENST00000481338	CFTR	P13569	1480 aa		32.99	■■■□□ 2.87
INF2-208	ENST00000481338	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.98	■■■□□ 2.87
INF2-208	ENST00000481338	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
INF2-208	ENST00000481338	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
INF2-208	ENST00000481338	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.69	■■■□□ 2.82
INF2-208	ENST00000481338	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.63	■■■□□ 2.81
INF2-208	ENST00000481338	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.54	■■■□□ 2.8
INF2-208	ENST00000481338	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.48	■■■□□ 2.79
INF2-208	ENST00000481338	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
INF2-208	ENST00000481338	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.37	■■■□□ 2.77
INF2-208	ENST00000481338	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.37	■■■□□ 2.77
INF2-208	ENST00000481338	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.28	■■■□□ 2.76
INF2-208	ENST00000481338	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.28	■■■□□ 2.76
INF2-208	ENST00000481338	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.28	■■■□□ 2.76
INF2-208	ENST00000481338	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
INF2-208	ENST00000481338	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.23	■■■□□ 2.75
INF2-208	ENST00000481338	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.16	■■■□□ 2.74
INF2-208	ENST00000481338	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
INF2-208	ENST00000481338	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.14	■■■□□ 2.74
INF2-208	ENST00000481338	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.04	■■■□□ 2.72	2e-6	■■■■■ 26.9
INF2-208	ENST00000481338	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
INF2-208	ENST00000481338	CHD1	O14646	1710 aa		32.02	■■■□□ 2.72
INF2-208	ENST00000481338	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.91	■■■□□ 2.7
INF2-208	ENST00000481338	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.85	■■■□□ 2.69
INF2-208	ENST00000481338	SOGA1	O94964	1423 aa		31.78	■■■□□ 2.68
INF2-208	ENST00000481338	CUX1	P39880	1505 aa		31.78	■■■□□ 2.68
INF2-208	ENST00000481338	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
INF2-208	ENST00000481338	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.78	■■■□□ 2.68
INF2-208	ENST00000481338	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.75	■■■□□ 2.67
INF2-208	ENST00000481338	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.74	■■■□□ 2.67
INF2-208	ENST00000481338	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.72	■■■□□ 2.67
INF2-208	ENST00000481338	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.71	■■■□□ 2.67
INF2-208	ENST00000481338	FBLN2	P98095	1184 aa		31.65	■■■□□ 2.66
INF2-208	ENST00000481338	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
INF2-208	ENST00000481338	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.57	■■■□□ 2.64
INF2-208	ENST00000481338	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.52	■■■□□ 2.64
INF2-208	ENST00000481338	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.51	■■■□□ 2.63
INF2-208	ENST00000481338	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.48	■■■□□ 2.63
INF2-208	ENST00000481338	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.46	■■■□□ 2.63
INF2-208	ENST00000481338	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
INF2-208	ENST00000481338	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.43	■■■□□ 2.62
INF2-208	ENST00000481338	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.42	■■■□□ 2.62
INF2-208	ENST00000481338	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
INF2-208	ENST00000481338	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.22	■■■□□ 2.59
INF2-208	ENST00000481338	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.22	■■■□□ 2.59
INF2-208	ENST00000481338	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.2	■■■□□ 2.58
INF2-208	ENST00000481338	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.2	■■■□□ 2.58
INF2-208	ENST00000481338	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.16	■■■□□ 2.58
INF2-208	ENST00000481338	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.16	■■■□□ 2.58
INF2-208	ENST00000481338	NUP160	Q12769	1436 aa		31.15	■■■□□ 2.58
INF2-208	ENST00000481338	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.14	■■■□□ 2.58
INF2-208	ENST00000481338	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
INF2-208	ENST00000481338	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.09	■■■□□ 2.57
INF2-208	ENST00000481338	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.01	■■■□□ 2.55
INF2-208	ENST00000481338	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.99	■■■□□ 2.55
INF2-208	ENST00000481338	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.78	■■■□□ 2.52
INF2-208	ENST00000481338	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.77	■■■□□ 2.52
INF2-208	ENST00000481338	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		30.75	■■■□□ 2.51
INF2-208	ENST00000481338	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.67	■■■□□ 2.5

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