Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.68e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 SGPL1-206ENST00000613857 541 ntTSL 411.94□□□□□ -0.58e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 SGPL1-205ENST00000611290 670 ntTSL 59.51□□□□□ -0.898e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 SGPL1-201ENST00000299297 658 ntTSL 26.01□□□□□ -1.458e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.021e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 EPS8L2-213ENST00000529346 1718 ntTSL 221.98■■□□□ 1.114e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.552e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.722e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.772e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TPM3-213ENST00000368545 2147 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.952e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 27.63□□□□□ -1.192e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-235ENST00000506147 580 ntTSL 415.41■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-239ENST00000514694 587 ntTSL 414.7□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-238ENST00000512107 579 ntTSL 413.99□□□□□ -0.172e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-236ENST00000509644 750 ntTSL 311.76□□□□□ -0.532e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-234ENST00000505016 664 ntTSL 211.23□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.482e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 ATF7-210ENST00000588232 531 ntTSL 410.54□□□□□ -0.729e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 ATF7-209ENST00000588078 531 ntTSL 57.58□□□□□ -1.29e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 ATF7-208ENST00000551480 473 ntTSL 56.47□□□□□ -1.379e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 ARHGAP17-218ENST00000575656 978 ntTSL 38.83□□□□□ -12e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MBD6-204ENST00000547545 1884 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.633e-9■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 HPN-204ENST00000593305 2175 ntTSL 219.56■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 HPN-203ENST00000541345 1820 ntTSL 217.38■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.648e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.528e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 CLK2-204ENST00000471047 701 ntTSL 39.6□□□□□ -0.878e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 MLXIPL-210ENST00000476404 1921 ntTSL 215.92■□□□□ 0.147e-9■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 EVPL-203ENST00000587569 6592 ntTSL 215.44■□□□□ 0.063e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.611e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.881e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 AKT2-203ENST00000391844 1795 ntTSL 1 (best)23.45■■□□□ 1.347e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.671e-8■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 HIF1A-206ENST00000553999 616 ntTSL 419.27■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 IGDCC3-204ENST00000559231 748 ntTSL 313.72□□□□□ -0.216e-9■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 HIF1A-202ENST00000337138 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 HIF1A-210ENST00000557206 767 ntTSL 36.75□□□□□ -1.331e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.951e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.041e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.181e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.643e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.643e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.323e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.093e-7■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 17.3
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.864e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.684e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-220ENST00000524062 2285 ntTSL 216.26■□□□□ 0.194e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.044e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.574e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-218ENST00000523445 856 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.874e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.224e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.294e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.444e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 522.27■■□□□ 1.163e-8■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.098e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.992e-8■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TMCC1-205ENST00000505616 402 ntTSL 29.97□□□□□ -0.814e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.984e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.154e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 ITPR2-203ENST00000451599 2577 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.839e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD3-224ENST00000602131 503 ntTSL 218.02■□□□□ 0.484e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD3-216ENST00000594085 503 ntTSL 218.02■□□□□ 0.484e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD3-219ENST00000598962 580 ntTSL 417.84■□□□□ 0.454e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD3-222ENST00000600479 477 ntTSL 415.49■□□□□ 0.074e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD3-203ENST00000392032 873 ntTSL 514.85□□□□□ -0.034e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD3-217ENST00000594908 804 ntTSL 314.58□□□□□ -0.084e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD3-218ENST00000596682 443 ntTSL 314.58□□□□□ -0.084e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD3-223ENST00000600948 536 ntTSL 214.54□□□□□ -0.084e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD3-221ENST00000599685 544 ntTSL 212.59□□□□□ -0.394e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 UCKL1-205ENST00000483710 524 ntTSL 39.75□□□□□ -0.857e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.281e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 NF1-207ENST00000468273 592 ntTSL 28.5□□□□□ -1.053e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 NF1-218ENST00000577967 5799 nt4.54□□□□□ -1.683e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 518.9■□□□□ 0.629e-8■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.386e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 ST3GAL1-202ENST00000517668 665 ntTSL 518.23■□□□□ 0.513e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 ST3GAL1-204ENST00000519435 1050 ntTSL 312.96□□□□□ -0.333e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.543e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 ST3GAL1-212ENST00000522873 613 ntTSL 311.43□□□□□ -0.583e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 ST3GAL1-203ENST00000518298 921 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.953e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.044e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 ITFG1-212ENST00000569551 559 ntTSL 56.2□□□□□ -1.423e-7■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.013e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)6.96□□□□□ -1.293e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.187e-18■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 IPO4-218ENST00000561199 3249 ntTSL 211.82□□□□□ -0.523e-6■■■□□ 17.2
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 206.4 ms