RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517668.5

ST3GAL1-202, Transcript of ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ST3GAL1, Length 665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL1-202ENST00000517668 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.46■■■■■ 5.19
ST3GAL1-202ENST00000517668 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.24■■■■■ 4.35
ST3GAL1-202ENST00000517668 ABCC9O60706 1549 aa41.59■■■■■ 4.25
ST3GAL1-202ENST00000517668 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.91■■■■□ 3.98
ST3GAL1-202ENST00000517668 NACADO15069 1562 aa39.83■■■■□ 3.97
ST3GAL1-202ENST00000517668 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.75■■■■□ 3.95
ST3GAL1-202ENST00000517668 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.55■■■■□ 3.92
ST3GAL1-202ENST00000517668 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
ST3GAL1-202ENST00000517668 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.28■■■■□ 3.88
ST3GAL1-202ENST00000517668 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.88■■■■□ 3.81
ST3GAL1-202ENST00000517668 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.85■■■■□ 3.81
ST3GAL1-202ENST00000517668 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.7■■■■□ 3.79
ST3GAL1-202ENST00000517668 SCRIBQ14160 1630 aa38.49■■■■□ 3.75
ST3GAL1-202ENST00000517668 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.45■■■■□ 3.75
ST3GAL1-202ENST00000517668 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.34■■■■□ 3.73
ST3GAL1-202ENST00000517668 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
ST3GAL1-202ENST00000517668 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.59■■■■□ 3.61
ST3GAL1-202ENST00000517668 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.42■■■■□ 3.58
ST3GAL1-202ENST00000517668 SMARCA4P51532 1647 aa36.82■■■■□ 3.49
ST3GAL1-202ENST00000517668 NCAPD3P42695 1498 aa36.8■■■■□ 3.48
ST3GAL1-202ENST00000517668 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
ST3GAL1-202ENST00000517668 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.75■■■■□ 3.47
ST3GAL1-202ENST00000517668 SMARCA2P51531 1590 aa36.67■■■■□ 3.46
ST3GAL1-202ENST00000517668 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.54■■■■□ 3.44
ST3GAL1-202ENST00000517668 HMGXB3Q12766 1538 aa36.54■■■■□ 3.44
ST3GAL1-202ENST00000517668 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.52■■■■□ 3.44
ST3GAL1-202ENST00000517668 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
ST3GAL1-202ENST00000517668 WIZO95785 1651 aa36.09■■■■□ 3.37
ST3GAL1-202ENST00000517668 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
ST3GAL1-202ENST00000517668 NESP48681 1621 aa35.9■■■■□ 3.34
ST3GAL1-202ENST00000517668 ERCC6Q03468 1493 aa35.87■■■■□ 3.33
ST3GAL1-202ENST00000517668 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.81■■■■□ 3.32
ST3GAL1-202ENST00000517668 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
ST3GAL1-202ENST00000517668 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.71■■■■□ 3.31
ST3GAL1-202ENST00000517668 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.62■■■■□ 3.29
ST3GAL1-202ENST00000517668 CUX2O14529 1486 aa35.61■■■■□ 3.29
ST3GAL1-202ENST00000517668 CFTRP13569 1480 aa35.43■■■■□ 3.26
ST3GAL1-202ENST00000517668 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.4■■■■□ 3.26
ST3GAL1-202ENST00000517668 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
ST3GAL1-202ENST00000517668 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.35■■■■□ 3.25
ST3GAL1-202ENST00000517668 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.25■■■■□ 3.23
ST3GAL1-202ENST00000517668 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.23■■■■□ 3.23
ST3GAL1-202ENST00000517668 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.22■■■■□ 3.23
ST3GAL1-202ENST00000517668 WDR62O43379 1518 aa35.11■■■■□ 3.21
ST3GAL1-202ENST00000517668 PRDM2Q13029 1718 aa34.98■■■■□ 3.19
ST3GAL1-202ENST00000517668 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
ST3GAL1-202ENST00000517668 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
ST3GAL1-202ENST00000517668 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.86■■■■□ 3.17
ST3GAL1-202ENST00000517668 ABCC8Q09428 1581 aa34.69■■■■□ 3.14
ST3GAL1-202ENST00000517668 TOPBP1Q92547 1522 aa34.65■■■■□ 3.14
ST3GAL1-202ENST00000517668 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.58■■■■□ 3.13
ST3GAL1-202ENST00000517668 IFT140Q96RY7 1462 aa34.52■■■■□ 3.12
ST3GAL1-202ENST00000517668 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
ST3GAL1-202ENST00000517668 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
ST3GAL1-202ENST00000517668 CUX1P39880 1505 aa34.3■■■■□ 3.08
ST3GAL1-202ENST00000517668 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
ST3GAL1-202ENST00000517668 SOGA1O94964 1423 aa34.23■■■■□ 3.07
ST3GAL1-202ENST00000517668 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.21■■■■□ 3.07
ST3GAL1-202ENST00000517668 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.2■■■■□ 3.06
ST3GAL1-202ENST00000517668 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
ST3GAL1-202ENST00000517668 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.06
ST3GAL1-202ENST00000517668 OSCARQ8IYS5 282 aa34.14■■■■□ 3.06
ST3GAL1-202ENST00000517668 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
ST3GAL1-202ENST00000517668 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.02■■■■□ 3.04
ST3GAL1-202ENST00000517668 WDR97A6NE52 1622 aa34.01■■■■□ 3.04
ST3GAL1-202ENST00000517668 TOP2BQ02880 1626 aa33.93■■■■□ 3.02
ST3GAL1-202ENST00000517668 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.9■■■■□ 3.02
ST3GAL1-202ENST00000517668 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.9■■■■□ 3.02
ST3GAL1-202ENST00000517668 SYNJ1O43426 1573 aa33.88■■■■□ 3.01
ST3GAL1-202ENST00000517668 GRIN2BQ13224 1484 aa33.85■■■■□ 3.01
ST3GAL1-202ENST00000517668 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.82■■■■□ 3
ST3GAL1-202ENST00000517668 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.81■■■■□ 3
ST3GAL1-202ENST00000517668 FBLN2P98095 1184 aa33.79■■■■□ 3
ST3GAL1-202ENST00000517668 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
ST3GAL1-202ENST00000517668 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.74■■■□□ 2.99
ST3GAL1-202ENST00000517668 CHD1O14646 1710 aa33.73■■■□□ 2.99
ST3GAL1-202ENST00000517668 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
ST3GAL1-202ENST00000517668 SYNJ2O15056 1496 aa33.66■■■□□ 2.98
ST3GAL1-202ENST00000517668 PBRM1Q86U86 1689 aa33.65■■■□□ 2.98
ST3GAL1-202ENST00000517668 TRIM41Q8WV44 630 aa33.53■■■□□ 2.96
ST3GAL1-202ENST00000517668 ARHGEF11O15085 1522 aa33.51■■■□□ 2.95
ST3GAL1-202ENST00000517668 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.5■■■□□ 2.95
ST3GAL1-202ENST00000517668 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.5■■■□□ 2.95
ST3GAL1-202ENST00000517668 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.5■■■□□ 2.95
ST3GAL1-202ENST00000517668 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.48■■■□□ 2.95
ST3GAL1-202ENST00000517668 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.45■■■□□ 2.95
ST3GAL1-202ENST00000517668 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.44■■■□□ 2.94
ST3GAL1-202ENST00000517668 ADAMTS12P58397 1594 aa33.43■■■□□ 2.94
ST3GAL1-202ENST00000517668 GRIN2AQ12879 1464 aa33.4■■■□□ 2.94
ST3GAL1-202ENST00000517668 KIF27Q86VH2 1401 aa33.34■■■□□ 2.93
ST3GAL1-202ENST00000517668 NUP160Q12769 1436 aa33.28■■■□□ 2.92
ST3GAL1-202ENST00000517668 IGF1RP08069 1367 aa33.26■■■□□ 2.92
ST3GAL1-202ENST00000517668 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.26■■■□□ 2.91
ST3GAL1-202ENST00000517668 ARAP1Q96P48 1450 aa33.23■■■□□ 2.91
ST3GAL1-202ENST00000517668 CEP170Q5SW79 1584 aa33.21■■■□□ 2.91
ST3GAL1-202ENST00000517668 CUL7Q14999 1698 aa33.09■■■□□ 2.89
ST3GAL1-202ENST00000517668 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.04■■■□□ 2.88
ST3GAL1-202ENST00000517668 SHROOM2Q13796 1616 aa33.01■■■□□ 2.87
ST3GAL1-202ENST00000517668 JPH4Q96JJ6 628 aa32.98■■■□□ 2.87
ST3GAL1-202ENST00000517668 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.94■■■□□ 2.86
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