Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRP68Q9UHB9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SRP68Q9UHB9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRP68Q9UHB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms