Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV1Q8NER1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV1Q8NER1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPV1Q8NER1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPV1Q8NER1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms