Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4BQ13620 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
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