Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.235e-16■■■■■ 74.6
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RBM22Q9NW64 CCDC102B-202ENST00000577772 1537 ntTSL 27.39□□□□□ -1.231e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.311e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.741e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 CCDC102B-203ENST00000577800 589 ntTSL 32□□□□□ -2.091e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.181e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 CCDC102B-206ENST00000581103 324 ntTSL 50.65□□□□□ -2.311e-32■■■■■ 74.5
RBM22Q9NW64 TRIP12-215ENST00000479037 2938 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.277e-19■■■■■ 74.3
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RBM22Q9NW64 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 73.4
RBM22Q9NW64 UFD1-205ENST00000459854 5038 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 73.4
RBM22Q9NW64 NUP214-227ENST00000531929 593 ntTSL 40.98□□□□□ -2.252e-7■■■■■ 73.2
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RBM22Q9NW64 UBN1-204ENST00000586152 593 ntTSL 215.44■□□□□ 0.061e-13■■■■■ 72.8
RBM22Q9NW64 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-13■■■■■ 72.8
RBM22Q9NW64 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.191e-13■■■■■ 72.8
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RBM22Q9NW64 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-12■■■■■ 70
RBM22Q9NW64 SRP9-202ENST00000366838 540 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.553e-12■■■■■ 70
RBM22Q9NW64 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.893e-12■■■■■ 70
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RBM22Q9NW64 EIF4B-203ENST00000420463 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.447e-15■■■■■ 69.9
RBM22Q9NW64 EIF4B-202ENST00000416762 1985 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.567e-15■■■■■ 69.9
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RBM22Q9NW64 EIF4B-213ENST00000552490 841 ntTSL 28.67□□□□□ -1.027e-15■■■■■ 69.9
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RBM22Q9NW64 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.137e-15■■■■■ 69.9
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RBM22Q9NW64 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.013e-17■■■■■ 69.7
RBM22Q9NW64 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.33e-17■■■■■ 69.7
RBM22Q9NW64 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.453e-17■■■■■ 69.7
RBM22Q9NW64 FANCA-218ENST00000565582 812 ntTSL 311.89□□□□□ -0.513e-17■■■■■ 69.7
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RBM22Q9NW64 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.214e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-203ENST00000432543 3754 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.444e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.384e-13■■■■■ 69.6
RBM22Q9NW64 NAPB-205ENST00000472855 1651 ntTSL 26.32□□□□□ -1.44e-13■■■■■ 69.6
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RBM22Q9NW64 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 219.38■□□□□ 0.695e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 218.51■□□□□ 0.555e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.525e-24■■■■■ 66.5
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RBM22Q9NW64 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 50.98□□□□□ -2.255e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 50.64□□□□□ -2.315e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.375e-24■■■■■ 66.5
RBM22Q9NW64 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 65
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RBM22Q9NW64 FECH-209ENST00000592111 556 ntTSL 212.08□□□□□ -0.481e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 FECH-207ENST00000591215 590 ntTSL 510.41□□□□□ -0.741e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 29.78□□□□□ -0.841e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 UBE3C-208ENST00000497368 776 ntTSL 25.43□□□□□ -1.541e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.821e-15■■■■■ 65
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RBM22Q9NW64 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.245e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-222ENST00000479596 883 ntTSL 315.04■□□□□ -05e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-213ENST00000471044 753 ntTSL 212.47□□□□□ -0.415e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-209ENST00000467081 564 ntTSL 32.75□□□□□ -1.975e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-205ENST00000464575 505 ntTSL 42.2□□□□□ -2.065e-15■■■■■ 65
RBM22Q9NW64 CCNL1-220ENST00000478454 580 ntTSL 41.71□□□□□ -2.145e-15■■■■■ 65
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RBM22Q9NW64 APBB2-226ENST00000513516 537 ntTSL 517.6■□□□□ 0.416e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.236e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.26e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-223ENST00000512510 539 ntTSL 515.5■□□□□ 0.076e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.146e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.496e-14■■■■■ 64.5
RBM22Q9NW64 APBB2-213ENST00000507831 575 ntTSL 411.92□□□□□ -0.56e-14■■■■■ 64.5
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