Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 HDLBP-216ENST00000428482 1096 ntTSL 56.37□□□□□ -1.393e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-219ENST00000442714 569 ntTSL 46.35□□□□□ -1.393e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-205ENST00000413241 581 ntTSL 56.34□□□□□ -1.393e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-217ENST00000430918 612 ntTSL 36.32□□□□□ -1.43e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-213ENST00000427007 459 ntTSL 36.32□□□□□ -1.43e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-206ENST00000417540 525 ntTSL 46.23□□□□□ -1.413e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-230ENST00000462130 464 ntTSL 46.23□□□□□ -1.413e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 HDLBP-222ENST00000449504 566 ntTSL 54.46□□□□□ -1.73e-10■■■■■ 32.5
SRSF9Q13242 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.676e-8■■■■■ 32.1
SRSF9Q13242 RBM12B-208ENST00000627241 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.136e-8■■■■■ 32.1
SRSF9Q13242 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.156e-8■■■■■ 32.1
SRSF9Q13242 RBM12B-206ENST00000520961 507 ntTSL 34.23□□□□□ -1.736e-8■■■■■ 32.1
SRSF9Q13242 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 32
SRSF9Q13242 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 32
SRSF9Q13242 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-12■■■■■ 31.9
SRSF9Q13242 BLCAP-214ENST00000613961 4083 nt5.6□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 31.7
SRSF9Q13242 BLCAP-206ENST00000411780 714 ntTSL 34.97□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 31.7
SRSF9Q13242 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 512.07□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 29.9□□□□□ -0.821e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-202ENST00000449421 1287 ntTSL 28.79□□□□□ -11e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-211ENST00000579324 2010 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.161e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.191e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-224ENST00000583948 1197 ntTSL 27.34□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-216ENST00000581104 2233 ntTSL 26.2□□□□□ -1.421e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-219ENST00000582833 453 ntTSL 55.64□□□□□ -1.511e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-204ENST00000577208 572 ntTSL 45.06□□□□□ -1.61e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-221ENST00000583548 562 ntTSL 53.96□□□□□ -1.781e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 NUP85-222ENST00000583569 553 ntTSL 53.78□□□□□ -1.81e-9■■■■■ 31.2
SRSF9Q13242 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.126e-10■■■■■ 30.8
SRSF9Q13242 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.036e-10■■■■■ 30.8
SRSF9Q13242 HMGA2-208ENST00000537429 1527 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.036e-10■■■■■ 30.8
SRSF9Q13242 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.136e-10■■■■■ 30.8
SRSF9Q13242 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.176e-10■■■■■ 30.8
SRSF9Q13242 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.266e-10■■■■■ 30.8
SRSF9Q13242 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.586e-10■■■■■ 30.8
SRSF9Q13242 HMGA2-209ENST00000539662 485 ntTSL 36.58□□□□□ -1.366e-10■■■■■ 30.8
SRSF9Q13242 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-206ENST00000417682 1817 ntTSL 512.11□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-228ENST00000524296 2108 ntTSL 511.71□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-212ENST00000452250 2625 ntTSL 211.23□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-202ENST00000382162 5250 ntTSL 210.98□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-217ENST00000466991 545 ntTSL 59.68□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-226ENST00000491973 580 ntTSL 49.12□□□□□ -0.952e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 WDR6-219ENST00000498023 626 ntTSL 29.06□□□□□ -0.962e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 WDR6-218ENST00000492780 537 ntTSL 28.62□□□□□ -1.032e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.032e-9■■■■■ 30.6
SRSF9Q13242 ASPHD1-205ENST00000566693 1732 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.159e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 ASPHD1-202ENST00000414952 1451 ntTSL 214.67□□□□□ -0.069e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.389e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 ASPHD1-204ENST00000563177 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.53□□□□□ -0.49e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.529e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.199e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 SOX5-212ENST00000541536 2365 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.289e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.299e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 SOX5-204ENST00000441133 638 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.299e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.329e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.549e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.559e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 SOX5-201ENST00000367206 1816 ntTSL 24.99□□□□□ -1.619e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.619e-9■■■■■ 30
SRSF9Q13242 NECAB3-206ENST00000477778 462 ntTSL 37.45□□□□□ -1.223e-9■■■■■ 29.9
SRSF9Q13242 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-323■■■■■ 29.5
SRSF9Q13242 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 29.2
SRSF9Q13242 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 29.2
SRSF9Q13242 SECISBP2-205ENST00000470305 5405 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 29.2
SRSF9Q13242 SECISBP2-209ENST00000534113 3584 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 29.2
SRSF9Q13242 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 28.9
SRSF9Q13242 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 212.27□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 28.9
SRSF9Q13242 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.71e-8■■■■■ 28.6
SRSF9Q13242 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 28.6
SRSF9Q13242 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 28.4
SRSF9Q13242 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.073e-8■■■■■ 28.4
SRSF9Q13242 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC7.61□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 28.1
SRSF9Q13242 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.129e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.219e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 ARFIP2-207ENST00000529847 920 ntTSL 213.43□□□□□ -0.269e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.319e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 ARFIP2-208ENST00000530410 971 ntTSL 211.83□□□□□ -0.529e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.549e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.689e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 ARFIP2-209ENST00000531037 1560 ntTSL 310.15□□□□□ -0.789e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.89e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 ARFIP2-206ENST00000525329 563 ntTSL 47.88□□□□□ -1.159e-9■■■■■ 28
SRSF9Q13242 SET-208ENST00000477806 957 ntTSL 1 (best)7.13□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 27.7
SRSF9Q13242 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.266e-8■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.326e-8■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 TNRC6A-215ENST00000568903 943 ntTSL 26.06□□□□□ -1.446e-8■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 TNRC6A-212ENST00000567232 523 ntTSL 54.95□□□□□ -1.626e-8■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.296e-7■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 ABCC6-205ENST00000576204 1914 ntTSL 511.72□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 ABCC6-202ENST00000456970 4137 ntTSL 211.18□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 ZCCHC14-202ENST00000561928 2548 ntTSL 511.94□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 27.5
SRSF9Q13242 ZCCHC14-204ENST00000568020 6242 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 27.5
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