Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMG5Q9UPR3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG5Q9UPR3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG5Q9UPR3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms