Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLGN3Q9NZ94 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLGN3Q9NZ94 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLGN3Q9NZ94 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms