Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
NLGN3Q9NZ94 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NLGN3Q9NZ94 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLGN3Q9NZ94 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLGN3Q9NZ94 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLGN3Q9NZ94 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NLGN3Q9NZ94 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NLGN3Q9NZ94 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NLGN3Q9NZ94 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLGN3Q9NZ94 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NLGN3Q9NZ94 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NLGN3Q9NZ94 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLGN3Q9NZ94 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NLGN3Q9NZ94 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NLGN3Q9NZ94 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NLGN3Q9NZ94 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NLGN3Q9NZ94 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NLGN3Q9NZ94 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NLGN3Q9NZ94 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NLGN3Q9NZ94 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NLGN3Q9NZ94 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLGN3Q9NZ94 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLGN3Q9NZ94 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLGN3Q9NZ94 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLGN3Q9NZ94 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLGN3Q9NZ94 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLGN3Q9NZ94 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NLGN3Q9NZ94 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NLGN3Q9NZ94 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NLGN3Q9NZ94 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLGN3Q9NZ94 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLGN3Q9NZ94 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLGN3Q9NZ94 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLGN3Q9NZ94 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NLGN3Q9NZ94 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLGN3Q9NZ94 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLGN3Q9NZ94 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NLGN3Q9NZ94 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NLGN3Q9NZ94 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLGN3Q9NZ94 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLGN3Q9NZ94 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NLGN3Q9NZ94 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLGN3Q9NZ94 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLGN3Q9NZ94 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLGN3Q9NZ94 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLGN3Q9NZ94 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLGN3Q9NZ94 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLGN3Q9NZ94 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLGN3Q9NZ94 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLGN3Q9NZ94 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLGN3Q9NZ94 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLGN3Q9NZ94 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLGN3Q9NZ94 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NLGN3Q9NZ94 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLGN3Q9NZ94 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLGN3Q9NZ94 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLGN3Q9NZ94 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLGN3Q9NZ94 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLGN3Q9NZ94 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLGN3Q9NZ94 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLGN3Q9NZ94 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLGN3Q9NZ94 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLGN3Q9NZ94 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLGN3Q9NZ94 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLGN3Q9NZ94 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLGN3Q9NZ94 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLGN3Q9NZ94 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLGN3Q9NZ94 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLGN3Q9NZ94 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLGN3Q9NZ94 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLGN3Q9NZ94 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLGN3Q9NZ94 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLGN3Q9NZ94 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLGN3Q9NZ94 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLGN3Q9NZ94 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLGN3Q9NZ94 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLGN3Q9NZ94 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLGN3Q9NZ94 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLGN3Q9NZ94 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLGN3Q9NZ94 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLGN3Q9NZ94 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLGN3Q9NZ94 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLGN3Q9NZ94 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLGN3Q9NZ94 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLGN3Q9NZ94 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLGN3Q9NZ94 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NLGN3Q9NZ94 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLGN3Q9NZ94 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLGN3Q9NZ94 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLGN3Q9NZ94 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLGN3Q9NZ94 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NLGN3Q9NZ94 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLGN3Q9NZ94 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLGN3Q9NZ94 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLGN3Q9NZ94 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLGN3Q9NZ94 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLGN3Q9NZ94 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLGN3Q9NZ94 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLGN3Q9NZ94 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLGN3Q9NZ94 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms