Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VAT1LQ9HCJ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAT1LQ9HCJ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VAT1LQ9HCJ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms