Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
VAT1LQ9HCJ6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
VAT1LQ9HCJ6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
VAT1LQ9HCJ6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
VAT1LQ9HCJ6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
VAT1LQ9HCJ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
VAT1LQ9HCJ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
VAT1LQ9HCJ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
VAT1LQ9HCJ6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
VAT1LQ9HCJ6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
VAT1LQ9HCJ6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
VAT1LQ9HCJ6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
VAT1LQ9HCJ6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
VAT1LQ9HCJ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
VAT1LQ9HCJ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
VAT1LQ9HCJ6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
VAT1LQ9HCJ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
VAT1LQ9HCJ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
VAT1LQ9HCJ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
VAT1LQ9HCJ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
VAT1LQ9HCJ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
VAT1LQ9HCJ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
VAT1LQ9HCJ6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
VAT1LQ9HCJ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
VAT1LQ9HCJ6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VAT1LQ9HCJ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
VAT1LQ9HCJ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
VAT1LQ9HCJ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
VAT1LQ9HCJ6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
VAT1LQ9HCJ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
VAT1LQ9HCJ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
VAT1LQ9HCJ6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
VAT1LQ9HCJ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
VAT1LQ9HCJ6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
VAT1LQ9HCJ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
VAT1LQ9HCJ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
VAT1LQ9HCJ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
VAT1LQ9HCJ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
VAT1LQ9HCJ6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
VAT1LQ9HCJ6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
VAT1LQ9HCJ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VAT1LQ9HCJ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
VAT1LQ9HCJ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
VAT1LQ9HCJ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
VAT1LQ9HCJ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
VAT1LQ9HCJ6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
VAT1LQ9HCJ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
VAT1LQ9HCJ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
VAT1LQ9HCJ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
VAT1LQ9HCJ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
VAT1LQ9HCJ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
VAT1LQ9HCJ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
VAT1LQ9HCJ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
VAT1LQ9HCJ6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VAT1LQ9HCJ6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
VAT1LQ9HCJ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
VAT1LQ9HCJ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
VAT1LQ9HCJ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VAT1LQ9HCJ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
VAT1LQ9HCJ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
VAT1LQ9HCJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
VAT1LQ9HCJ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
VAT1LQ9HCJ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
VAT1LQ9HCJ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VAT1LQ9HCJ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VAT1LQ9HCJ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VAT1LQ9HCJ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
VAT1LQ9HCJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
VAT1LQ9HCJ6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
VAT1LQ9HCJ6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
VAT1LQ9HCJ6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VAT1LQ9HCJ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
VAT1LQ9HCJ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VAT1LQ9HCJ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VAT1LQ9HCJ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VAT1LQ9HCJ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VAT1LQ9HCJ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VAT1LQ9HCJ6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
VAT1LQ9HCJ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VAT1LQ9HCJ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VAT1LQ9HCJ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VAT1LQ9HCJ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VAT1LQ9HCJ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VAT1LQ9HCJ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
VAT1LQ9HCJ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
VAT1LQ9HCJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.8■■■■□ 3
VAT1LQ9HCJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
VAT1LQ9HCJ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
VAT1LQ9HCJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VAT1LQ9HCJ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VAT1LQ9HCJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
VAT1LQ9HCJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
VAT1LQ9HCJ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VAT1LQ9HCJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
VAT1LQ9HCJ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VAT1LQ9HCJ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VAT1LQ9HCJ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms