Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTKNQ9BST9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTKNQ9BST9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms