Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPROQ16827 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPROQ16827 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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