Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPROQ16827 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPROQ16827 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPROQ16827 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPROQ16827 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPROQ16827 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PTPROQ16827 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPROQ16827 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPROQ16827 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPROQ16827 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPROQ16827 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPROQ16827 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPROQ16827 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPROQ16827 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPROQ16827 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPROQ16827 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPROQ16827 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPROQ16827 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPROQ16827 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPROQ16827 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPROQ16827 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPROQ16827 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPROQ16827 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPROQ16827 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPROQ16827 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPROQ16827 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPROQ16827 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPROQ16827 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPROQ16827 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPROQ16827 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPROQ16827 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPROQ16827 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPROQ16827 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPROQ16827 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPROQ16827 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PTPROQ16827 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPROQ16827 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPROQ16827 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPROQ16827 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPROQ16827 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPROQ16827 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPROQ16827 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPROQ16827 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPROQ16827 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPROQ16827 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPROQ16827 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPROQ16827 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPROQ16827 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPROQ16827 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPROQ16827 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPROQ16827 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPROQ16827 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPROQ16827 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPROQ16827 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPROQ16827 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPROQ16827 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPROQ16827 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPROQ16827 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPROQ16827 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPROQ16827 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPROQ16827 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPROQ16827 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPROQ16827 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPROQ16827 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPROQ16827 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPROQ16827 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPROQ16827 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPROQ16827 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPROQ16827 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPROQ16827 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPROQ16827 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPROQ16827 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPROQ16827 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPROQ16827 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPROQ16827 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPROQ16827 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPROQ16827 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPROQ16827 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PTPROQ16827 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPROQ16827 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPROQ16827 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPROQ16827 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPROQ16827 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPROQ16827 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPROQ16827 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPROQ16827 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPROQ16827 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPROQ16827 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPROQ16827 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPROQ16827 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPROQ16827 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPROQ16827 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPROQ16827 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPROQ16827 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPROQ16827 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPROQ16827 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPROQ16827 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPROQ16827 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPROQ16827 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPROQ16827 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
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