Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
SMARCA4P51532 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC43.13■■■■■ 4.5
SMARCA4P51532 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
SMARCA4P51532 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SMARCA4P51532 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC43■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
SMARCA4P51532 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms