Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA1P25391 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA1P25391 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms