Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.59e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.689e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.639e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.053e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RBM33-209ENST00000440108 1027 ntTSL 516.68■□□□□ 0.265e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RBM33-206ENST00000392761 2934 ntTSL 213.3□□□□□ -0.285e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.615e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RBM33-202ENST00000307403 4360 ntTSL 210.22□□□□□ -0.775e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 09e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.279e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.279e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.439e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 221.14■□□□□ 0.979e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EHBP1-205ENST00000413434 533 ntTSL 49.67□□□□□ -0.869e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EHBP1-217ENST00000472809 1374 ntTSL 58.99□□□□□ -0.979e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 58.57□□□□□ -1.049e-7■■■□□ 18.9
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PCBP2Q15366 EHBP1-208ENST00000427809 581 ntTSL 45.47□□□□□ -1.539e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)5.4□□□□□ -1.549e-7■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 512.26□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.862e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.061e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PLEKHA1-206ENST00000463663 617 ntTSL 523.26■■□□□ 1.313e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TMEM18-206ENST00000461640 844 ntTSL 320.86■□□□□ 0.939e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.883e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.873e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 CEP164-204ENST00000527609 585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)20.35■□□□□ 0.853e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 C9orf3-208ENST00000451893 514 ntTSL 320.15■□□□□ 0.823e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-202ENST00000371520 1606 ntTSL 1 (best)19.47■□□□□ 0.713e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-225ENST00000544365 1335 ntTSL 519.36■□□□□ 0.693e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.693e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-206ENST00000467988 702 ntTSL 519.25■□□□□ 0.673e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PLEKHA1-208ENST00000494222 603 ntTSL 319.13■□□□□ 0.653e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 CEP164-202ENST00000525416 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.06■□□□□ 0.643e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NFKB1-206ENST00000507079 965 ntTSL 518.52■□□□□ 0.564e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.533e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-201ENST00000322910 2352 ntTSL 218.34■□□□□ 0.533e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)18.27■□□□□ 0.523e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-219ENST00000495920 456 ntTSL 318.2■□□□□ 0.53e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.443e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-237ENST00000583858 1015 ntTSL 517.73■□□□□ 0.433e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-208ENST00000476477 1676 ntTSL 217.58■□□□□ 0.43e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-232ENST00000583074 410 ntTSL 517.51■□□□□ 0.393e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-236ENST00000583850 903 ntTSL 217.34■□□□□ 0.373e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.293e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TAF15-203ENST00000603393 1214 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.269e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.263e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-204ENST00000460612 2645 ntTSL 216.63■□□□□ 0.253e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-220ENST00000579546 582 ntTSL 516.6■□□□□ 0.253e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 416.6■□□□□ 0.253e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RNF167-212ENST00000575400 858 ntTSL 316.23■□□□□ 0.193e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-214ENST00000578711 1732 nt16.09■□□□□ 0.173e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-204ENST00000542255 1016 ntTSL 515.87■□□□□ 0.133e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-218ENST00000579391 341 ntTSL 215.12■□□□□ 0.013e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 515.05■□□□□ -03e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ITGB1-211ENST00000475184 552 ntTSL 414.67□□□□□ -0.063e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ITGB1-204ENST00000417122 569 ntTSL 414.64□□□□□ -0.073e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.083e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-215ENST00000487866 940 ntTSL 514.41□□□□□ -0.13e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 214.18□□□□□ -0.143e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-231ENST00000582450 294 ntTSL 214.08□□□□□ -0.163e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-219ENST00000579425 1234 ntTSL 514.05□□□□□ -0.163e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-239ENST00000585203 947 ntTSL 514.05□□□□□ -0.163e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ARAP1-208ENST00000452383 994 ntTSL 313.88□□□□□ -0.198e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.74□□□□□ -0.213e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-210ENST00000479593 766 ntTSL 513.67□□□□□ -0.223e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.264e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SIL1-204ENST00000503732 690 ntTSL 313.42□□□□□ -0.263e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TNS3-202ENST00000413551 698 ntTSL 513.31□□□□□ -0.283e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RNF167-203ENST00000570492 766 ntTSL 313.22□□□□□ -0.293e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SEC23B-205ENST00000422877 834 ntTSL 313.18□□□□□ -0.33e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TAF15-212ENST00000604879 808 ntTSL 513.16□□□□□ -0.39e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 TAF15-213ENST00000605197 760 ntTSL 213.16□□□□□ -0.39e-12■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 UBASH3B-202ENST00000525711 572 ntTSL 413.11□□□□□ -0.313e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ARFRP1-204ENST00000609537 593 ntTSL 312.89□□□□□ -0.353e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.353e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.354e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PLXNB2-206ENST00000434732 253 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-214ENST00000487851 471 ntTSL 312.82□□□□□ -0.363e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.393e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-215ENST00000578809 709 ntTSL 212.58□□□□□ -0.43e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.453e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 CEP164-208ENST00000533153 585 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.2□□□□□ -0.463e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ARAP1-206ENST00000427971 1101 ntTSL 512.14□□□□□ -0.478e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-211ENST00000578319 718 ntTSL 311.98□□□□□ -0.493e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-205ENST00000463923 663 ntTSL 311.77□□□□□ -0.533e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.533e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RNF167-213ENST00000575524 619 ntTSL 211.39□□□□□ -0.593e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ACADVL-235ENST00000583848 503 ntTSL 311.38□□□□□ -0.593e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NFKB1-205ENST00000505458 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.614e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.623e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-217ENST00000492992 370 ntTSL 311.2□□□□□ -0.623e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.73e-8■■■□□ 18.9
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