RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.1■■■■□ 3.37
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UBASH3B-202ENST00000525711 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.27■■■□□ 2.6
UBASH3B-202ENST00000525711 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.07■■■□□ 2.56
UBASH3B-202ENST00000525711 NACADO15069 1562 aa30.94■■■□□ 2.54
UBASH3B-202ENST00000525711 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.64■■■□□ 2.5
UBASH3B-202ENST00000525711 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.58■■■□□ 2.49
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UBASH3B-202ENST00000525711 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.37■■■□□ 2.45
UBASH3B-202ENST00000525711 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.29■■■□□ 2.44
UBASH3B-202ENST00000525711 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.93■■■□□ 2.38
UBASH3B-202ENST00000525711 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
UBASH3B-202ENST00000525711 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.83■■■□□ 2.37
UBASH3B-202ENST00000525711 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.78■■■□□ 2.36
UBASH3B-202ENST00000525711 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.71■■■□□ 2.35
UBASH3B-202ENST00000525711 SCRIBQ14160 1630 aa29.7■■■□□ 2.34
UBASH3B-202ENST00000525711 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
UBASH3B-202ENST00000525711 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.89■■■□□ 2.22
UBASH3B-202ENST00000525711 CUX2O14529 1486 aa28.59■■■□□ 2.17
UBASH3B-202ENST00000525711 ERCC6Q03468 1493 aa28.51■■■□□ 2.15
UBASH3B-202ENST00000525711 NCAPD3P42695 1498 aa28.49■■■□□ 2.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.34■■■□□ 2.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SMARCA2P51531 1590 aa28.33■■■□□ 2.13
UBASH3B-202ENST00000525711 HMGXB3Q12766 1538 aa28.33■■■□□ 2.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SMARCA4P51532 1647 aa28.31■■■□□ 2.12
UBASH3B-202ENST00000525711 NESP48681 1621 aa28.14■■■□□ 2.1
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UBASH3B-202ENST00000525711 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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UBASH3B-202ENST00000525711 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.01■■■□□ 2.07
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.93■■■□□ 2.06
UBASH3B-202ENST00000525711 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.8■■■□□ 2.04
UBASH3B-202ENST00000525711 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.78■■■□□ 2.04
UBASH3B-202ENST00000525711 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.59■■■□□ 2.01
UBASH3B-202ENST00000525711 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.58■■■□□ 2.01
UBASH3B-202ENST00000525711 WDR62O43379 1518 aa27.55■■■□□ 2
UBASH3B-202ENST00000525711 WIZO95785 1651 aa27.51■■□□□ 1.99
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM41Q8WV44 630 aa27.5■■□□□ 1.99
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.42■■□□□ 1.98
UBASH3B-202ENST00000525711 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.32■■□□□ 1.96
UBASH3B-202ENST00000525711 CFTRP13569 1480 aa27.21■■□□□ 1.95
UBASH3B-202ENST00000525711 PRDM2Q13029 1718 aa27.16■■□□□ 1.94
UBASH3B-202ENST00000525711 OSCARQ8IYS5 282 aa27.14■■□□□ 1.94
UBASH3B-202ENST00000525711 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
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UBASH3B-202ENST00000525711 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
UBASH3B-202ENST00000525711 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.93■■□□□ 1.9
UBASH3B-202ENST00000525711 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.93■■□□□ 1.9
UBASH3B-202ENST00000525711 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.93■■□□□ 1.9
UBASH3B-202ENST00000525711 IFT140Q96RY7 1462 aa26.87■■□□□ 1.89
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGEF11O15085 1522 aa26.76■■□□□ 1.87
UBASH3B-202ENST00000525711 TOPBP1Q92547 1522 aa26.76■■□□□ 1.87
UBASH3B-202ENST00000525711 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.75■■□□□ 1.87
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCC8Q09428 1581 aa26.74■■□□□ 1.87
UBASH3B-202ENST00000525711 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.68■■□□□ 1.86
UBASH3B-202ENST00000525711 CHD1O14646 1710 aa26.68■■□□□ 1.86
UBASH3B-202ENST00000525711 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
UBASH3B-202ENST00000525711 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.52■■□□□ 1.84
UBASH3B-202ENST00000525711 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
UBASH3B-202ENST00000525711 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
UBASH3B-202ENST00000525711 ARAP1Q96P48 1450 aa26.44■■□□□ 1.82
UBASH3B-202ENST00000525711 FBLN2P98095 1184 aa26.42■■□□□ 1.82
UBASH3B-202ENST00000525711 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBASH3B-202ENST00000525711 WDR97A6NE52 1622 aa26.37■■□□□ 1.81
UBASH3B-202ENST00000525711 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.33■■□□□ 1.81
UBASH3B-202ENST00000525711 SOGA1O94964 1423 aa26.31■■□□□ 1.8
UBASH3B-202ENST00000525711 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.28■■□□□ 1.8
UBASH3B-202ENST00000525711 SYNJ1O43426 1573 aa26.28■■□□□ 1.8
UBASH3B-202ENST00000525711 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
UBASH3B-202ENST00000525711 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.27■■□□□ 1.8
UBASH3B-202ENST00000525711 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.24■■□□□ 1.79
UBASH3B-202ENST00000525711 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
UBASH3B-202ENST00000525711 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
UBASH3B-202ENST00000525711 PBRM1Q86U86 1689 aa26.17■■□□□ 1.78
UBASH3B-202ENST00000525711 GRIN2BQ13224 1484 aa26.16■■□□□ 1.78
UBASH3B-202ENST00000525711 CUX1P39880 1505 aa26.14■■□□□ 1.78
UBASH3B-202ENST00000525711 SYNJ2O15056 1496 aa26.12■■□□□ 1.77
UBASH3B-202ENST00000525711 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.01■■□□□ 1.75
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.98■■□□□ 1.75
UBASH3B-202ENST00000525711 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.93■■□□□ 1.74
UBASH3B-202ENST00000525711 GRIN2AQ12879 1464 aa25.83■■□□□ 1.73
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAMTS12P58397 1594 aa25.8■■□□□ 1.72
UBASH3B-202ENST00000525711 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.78■■□□□ 1.72
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP170Q5SW79 1584 aa25.76■■□□□ 1.71
UBASH3B-202ENST00000525711 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
UBASH3B-202ENST00000525711 SHROOM2Q13796 1616 aa25.74■■□□□ 1.71
UBASH3B-202ENST00000525711 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.73■■□□□ 1.71
UBASH3B-202ENST00000525711 NUP160Q12769 1436 aa25.72■■□□□ 1.71
UBASH3B-202ENST00000525711 TOP2BQ02880 1626 aa25.68■■□□□ 1.7
UBASH3B-202ENST00000525711 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.66■■□□□ 1.7
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.66■■□□□ 1.7
UBASH3B-202ENST00000525711 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.63■■□□□ 1.69
UBASH3B-202ENST00000525711 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
UBASH3B-202ENST00000525711 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
UBASH3B-202ENST00000525711 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.46■■□□□ 1.67
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