Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCER2I3L3R5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms