RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362076.8

C1orf43-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf43, Length 1,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-202ENST00000362076 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.99■■■■□ 3.35
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C1orf43-202ENST00000362076 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.64■■■□□ 2.33
C1orf43-202ENST00000362076 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.5■■■□□ 2.31
C1orf43-202ENST00000362076 ABCC9O60706 1549 aa29.5■■■□□ 2.31
C1orf43-202ENST00000362076 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.27■■■□□ 2.28
C1orf43-202ENST00000362076 NACADO15069 1562 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf43-202ENST00000362076 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.96■■■□□ 2.23
C1orf43-202ENST00000362076 SCRIBQ14160 1630 aa28.76■■■□□ 2.19
C1orf43-202ENST00000362076 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.28■■■□□ 2.12
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C1orf43-202ENST00000362076 BICRAQ9NZM4 1560 aa28■■■□□ 2.07
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C1orf43-202ENST00000362076 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.88■■■□□ 2.05
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C1orf43-202ENST00000362076 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.35■■□□□ 1.97
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C1orf43-202ENST00000362076 SMARCA2P51531 1590 aa27.22■■□□□ 1.95
C1orf43-202ENST00000362076 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.18■■□□□ 1.94
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C1orf43-202ENST00000362076 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.14■■□□□ 1.94
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C1orf43-202ENST00000362076 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.74■■□□□ 1.87
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C1orf43-202ENST00000362076 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.28■■□□□ 1.8
C1orf43-202ENST00000362076 PRDM2Q13029 1718 aa26.26■■□□□ 1.79
C1orf43-202ENST00000362076 SYNJ1O43426 1573 aa26.13■■□□□ 1.77
C1orf43-202ENST00000362076 TOP2BQ02880 1626 aa26.09■■□□□ 1.77
C1orf43-202ENST00000362076 EEA1Q15075 1411 aa26.08■■□□□ 1.76
C1orf43-202ENST00000362076 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.06■■□□□ 1.76
C1orf43-202ENST00000362076 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.05■■□□□ 1.76
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C1orf43-202ENST00000362076 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.03■■□□□ 1.76
C1orf43-202ENST00000362076 CUX1P39880 1505 aa25.96■■□□□ 1.75
C1orf43-202ENST00000362076 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.95■■□□□ 1.75
C1orf43-202ENST00000362076 SOGA1O94964 1423 aa25.93■■□□□ 1.74
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C1orf43-202ENST00000362076 NESP48681 1621 aa25.9■■□□□ 1.74
C1orf43-202ENST00000362076 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.87■■□□□ 1.73
C1orf43-202ENST00000362076 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.86■■□□□ 1.73
C1orf43-202ENST00000362076 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.8■■□□□ 1.72
C1orf43-202ENST00000362076 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.79■■□□□ 1.72
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C1orf43-202ENST00000362076 TOPBP1Q92547 1522 aa25.68■■□□□ 1.7
C1orf43-202ENST00000362076 KIF27Q86VH2 1401 aa25.68■■□□□ 1.7
C1orf43-202ENST00000362076 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.67■■□□□ 1.7
C1orf43-202ENST00000362076 KIF21BO75037 1637 aa25.65■■□□□ 1.7
C1orf43-202ENST00000362076 GOLGA3Q08378 1498 aa25.64■■□□□ 1.69
C1orf43-202ENST00000362076 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.62■■□□□ 1.69
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C1orf43-202ENST00000362076 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.59■■□□□ 1.69
C1orf43-202ENST00000362076 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.59■■□□□ 1.69
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C1orf43-202ENST00000362076 CUX2O14529 1486 aa25.53■■□□□ 1.68
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C1orf43-202ENST00000362076 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.5■■□□□ 1.67
C1orf43-202ENST00000362076 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.5■■□□□ 1.67
C1orf43-202ENST00000362076 PRXQ9BXM0 1461 aa25.49■■□□□ 1.67
C1orf43-202ENST00000362076 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.48■■□□□ 1.67
C1orf43-202ENST00000362076 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.42■■□□□ 1.66
C1orf43-202ENST00000362076 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.42■■□□□ 1.66
C1orf43-202ENST00000362076 IGF1RP08069 1367 aa25.41■■□□□ 1.66
C1orf43-202ENST00000362076 CEP162Q5TB80 1403 aa25.4■■□□□ 1.66
C1orf43-202ENST00000362076 WDR97A6NE52 1622 aa25.36■■□□□ 1.65
C1orf43-202ENST00000362076 ERCC6Q03468 1493 aa25.36■■□□□ 1.65
C1orf43-202ENST00000362076 WDR62O43379 1518 aa25.34■■□□□ 1.65
C1orf43-202ENST00000362076 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.3■■□□□ 1.64
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C1orf43-202ENST00000362076 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.25■■□□□ 1.63
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C1orf43-202ENST00000362076 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.22■■□□□ 1.63
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C1orf43-202ENST00000362076 IFT140Q96RY7 1462 aa25.21■■□□□ 1.63
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C1orf43-202ENST00000362076 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.01■■□□□ 1.59
C1orf43-202ENST00000362076 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.593e-6■■■□□ 18.5
C1orf43-202ENST00000362076 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.97■■□□□ 1.59
C1orf43-202ENST00000362076 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
C1orf43-202ENST00000362076 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.95■■□□□ 1.58
C1orf43-202ENST00000362076 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
C1orf43-202ENST00000362076 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.93■■□□□ 1.58
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C1orf43-202ENST00000362076 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.9■■□□□ 1.58
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