Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCER2I3L3R5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCER2I3L3R5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCER2I3L3R5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
CCER2I3L3R5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CCER2I3L3R5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
CCER2I3L3R5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CCER2I3L3R5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CCER2I3L3R5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CCER2I3L3R5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCER2I3L3R5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CCER2I3L3R5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CCER2I3L3R5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCER2I3L3R5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CCER2I3L3R5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCER2I3L3R5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
CCER2I3L3R5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCER2I3L3R5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CCER2I3L3R5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CCER2I3L3R5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CCER2I3L3R5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
CCER2I3L3R5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CCER2I3L3R5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CCER2I3L3R5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.39
CCER2I3L3R5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CCER2I3L3R5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CCER2I3L3R5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CCER2I3L3R5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCER2I3L3R5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CCER2I3L3R5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCER2I3L3R5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CCER2I3L3R5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCER2I3L3R5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CCER2I3L3R5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CCER2I3L3R5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CCER2I3L3R5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCER2I3L3R5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CCER2I3L3R5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CCER2I3L3R5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCER2I3L3R5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCER2I3L3R5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCER2I3L3R5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCER2I3L3R5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCER2I3L3R5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
CCER2I3L3R5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCER2I3L3R5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCER2I3L3R5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCER2I3L3R5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCER2I3L3R5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CCER2I3L3R5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CCER2I3L3R5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CCER2I3L3R5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CCER2I3L3R5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CCER2I3L3R5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCER2I3L3R5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CCER2I3L3R5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCER2I3L3R5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCER2I3L3R5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CCER2I3L3R5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CCER2I3L3R5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCER2I3L3R5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCER2I3L3R5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CCER2I3L3R5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CCER2I3L3R5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CCER2I3L3R5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CCER2I3L3R5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCER2I3L3R5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CCER2I3L3R5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CCER2I3L3R5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CCER2I3L3R5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCER2I3L3R5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CCER2I3L3R5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CCER2I3L3R5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCER2I3L3R5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CCER2I3L3R5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CCER2I3L3R5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCER2I3L3R5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
CCER2I3L3R5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCER2I3L3R5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCER2I3L3R5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCER2I3L3R5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCER2I3L3R5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCER2I3L3R5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
CCER2I3L3R5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CCER2I3L3R5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCER2I3L3R5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCER2I3L3R5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCER2I3L3R5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCER2I3L3R5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCER2I3L3R5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CCER2I3L3R5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCER2I3L3R5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCER2I3L3R5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CCER2I3L3R5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CCER2I3L3R5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CCER2I3L3R5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCER2I3L3R5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CCER2I3L3R5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCER2I3L3R5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CCER2I3L3R5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms