Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM8Q9UJA3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM8Q9UJA3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM8Q9UJA3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms