Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUSAP1Q9BXS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUSAP1Q9BXS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 713 ms