Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHISA4Q96DD7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA4Q96DD7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms