Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTROBQ8N137 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTROBQ8N137 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTROBQ8N137 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTROBQ8N137 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTROBQ8N137 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CNTROBQ8N137 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTROBQ8N137 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1945.1 ms