Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDF2Q6PJF5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDF2Q6PJF5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHBDF2Q6PJF5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms