Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 B4GALT3-210ENST00000487004 703 ntTSL 513.85□□□□□ -0.195e-9■■■■■ 53.2
EFTUD2Q15029 ANXA6-205ENST00000517707 603 ntTSL 210.53□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 53.1
EFTUD2Q15029 ANXA6-209ENST00000520054 487 ntTSL 310.34□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 53.1
EFTUD2Q15029 DVL2-204ENST00000573354 392 ntTSL 321.72■■□□□ 1.079e-12■■■■■ 53.1
EFTUD2Q15029 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.841e-12■■■■■ 52.9
EFTUD2Q15029 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-12■■■■■ 52.9
EFTUD2Q15029 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.411e-12■■■■■ 52.9
EFTUD2Q15029 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-12■■■■■ 52.9
EFTUD2Q15029 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.261e-12■■■■■ 52.9
EFTUD2Q15029 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.231e-12■■■■■ 52.9
EFTUD2Q15029 SLC3A2-212ENST00000538682 1368 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.161e-12■■■■■ 52.9
EFTUD2Q15029 SLC3A2-215ENST00000539891 1300 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.771e-12■■■■■ 52.9
EFTUD2Q15029 CXXC1-210ENST00000587396 476 ntTSL 216.48■□□□□ 0.237e-9■■■■■ 52.9
EFTUD2Q15029 SOX2-OT-241ENST00000626948 836 ntTSL 512.58□□□□□ -0.44e-19■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 SOX2-OT-256ENST00000630482 1012 ntTSL 511.19□□□□□ -0.624e-19■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 SOX2-OT-201ENST00000460739 609 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.654e-19■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 SOX2-OT-215ENST00000493521 1239 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.84e-19■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 SOX2-OT-226ENST00000597347 1342 ntTSL 59.18□□□□□ -0.944e-19■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 SOX2-OT-214ENST00000493116 560 ntTSL 45.14□□□□□ -1.594e-19■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 SOX2-OT-204ENST00000469278 561 ntTSL 42.83□□□□□ -1.964e-19■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.024e-19■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 PRR14-211ENST00000568754 856 ntTSL 317.24■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 TOMM40L-203ENST00000465512 669 ntTSL 215.68■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 52.8
EFTUD2Q15029 ATXN1L-203ENST00000569119 428 ntTSL 516.51■□□□□ 0.234e-9■■■■■ 52.7
EFTUD2Q15029 IST1-225ENST00000568581 503 ntTSL 513.74□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 52.7
EFTUD2Q15029 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.824e-9■■■■■ 52.7
EFTUD2Q15029 ATXN1L-202ENST00000565676 445 ntTSL 35.63□□□□□ -1.514e-9■■■■■ 52.7
EFTUD2Q15029 RUSC1-210ENST00000473331 782 ntTSL 222.51■■□□□ 1.192e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-215ENST00000492536 1069 ntTSL 322.03■■□□□ 1.122e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-207ENST00000467820 915 ntTSL 319.51■□□□□ 0.712e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-206ENST00000462780 2420 ntTSL 218.4■□□□□ 0.542e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-208ENST00000468764 682 ntTSL 317.88■□□□□ 0.452e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-216ENST00000497930 1156 ntTSL 317.71■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.32e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-213ENST00000489860 934 ntTSL 516■□□□□ 0.152e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.092e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 RUSC1-211ENST00000479924 930 ntTSL 314.93□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-11■■■■■ 52.6
EFTUD2Q15029 E2F4-211ENST00000568693 596 ntTSL 28.3□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 MECP2-218ENST00000629277 2558 nt19.84■□□□□ 0.776e-9■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 MECP2-216ENST00000627864 581 ntTSL 318.5■□□□□ 0.556e-9■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.086e-9■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.546e-9■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 MECP2-202ENST00000369957 784 ntTSL 38.93□□□□□ -0.986e-9■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 MECP2-220ENST00000631210 490 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.096e-9■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 311.57□□□□□ -0.562e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 511.35□□□□□ -0.592e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 211.1□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 210.52□□□□□ -0.732e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.31□□□□□ -0.922e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.992e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-221ENST00000531612 938 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.36□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 28.02□□□□□ -1.132e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.132e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 27.78□□□□□ -1.162e-10■■■■■ 52.5
EFTUD2Q15029 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 52.4
EFTUD2Q15029 CDH24-203ENST00000485922 2006 ntTSL 221.48■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 52.4
EFTUD2Q15029 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 52.4
EFTUD2Q15029 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 52.4
EFTUD2Q15029 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 52.4
EFTUD2Q15029 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 52.4
EFTUD2Q15029 EDC4-211ENST00000575514 1016 ntTSL 516.46■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 52.4
EFTUD2Q15029 PGF-208ENST00000557748 875 ntTSL 213.44□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 52.4
EFTUD2Q15029 PNP-201ENST00000361505 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PNP-208ENST00000557229 992 ntTSL 1 (best)11.79□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PNP-204ENST00000554056 1635 ntTSL 510.26□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PNP-203ENST00000553591 770 ntTSL 56.72□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.211e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.141e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CHID1-212ENST00000528426 991 ntTSL 527.31■■□□□ 1.962e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYT8-207ENST00000464897 1673 ntTSL 225.56■■□□□ 1.681e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-205ENST00000441156 2168 ntTSL 224.83■■□□□ 1.561e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PI4KA-215ENST00000485963 2301 ntTSL 224.77■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.482e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RP9-203ENST00000474370 535 ntTSL 223.43■■□□□ 1.342e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYT8-209ENST00000479089 1956 ntTSL 523.09■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYT8-210ENST00000479276 2520 ntTSL 222.34■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TBK1-203ENST00000538890 547 ntTSL 422.07■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CACTIN-205ENST00000587175 2216 ntTSL 521.5■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CACTIN-207ENST00000589321 1708 ntTSL 521.37■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 11e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RUBCN-210ENST00000474214 615 ntTSL 520.71■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BTBD2-206ENST00000589200 858 ntTSL 520.62■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-204ENST00000460315 723 ntTSL 320.58■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SRRT-218ENST00000620394 582 ntTSL 220.5■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 52.3
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