RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361505.9

PNP-201, Transcript of purine nucleoside phosphorylase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PNP, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNP-201ENST00000361505 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.71■■■□□ 2.19
PNP-201ENST00000361505 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.19■■□□□ 1.62
PNP-201ENST00000361505 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PNP-201ENST00000361505 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.84■■□□□ 1.41
PNP-201ENST00000361505 ABCC9O60706 1549 aa23.65■■□□□ 1.38
PNP-201ENST00000361505 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.61■■□□□ 1.37
PNP-201ENST00000361505 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.43■■□□□ 1.34
PNP-201ENST00000361505 NACADO15069 1562 aa23.41■■□□□ 1.34
PNP-201ENST00000361505 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.2■■□□□ 1.3
PNP-201ENST00000361505 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.14■■□□□ 1.3
PNP-201ENST00000361505 SCRIBQ14160 1630 aa22.99■■□□□ 1.27
PNP-201ENST00000361505 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.79■■□□□ 1.24
PNP-201ENST00000361505 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.5■■□□□ 1.19
PNP-201ENST00000361505 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.24■■□□□ 1.15
PNP-201ENST00000361505 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PNP-201ENST00000361505 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PNP-201ENST00000361505 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PNP-201ENST00000361505 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
PNP-201ENST00000361505 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.14■■□□□ 1.13
PNP-201ENST00000361505 SMARCA4P51532 1647 aa22.11■■□□□ 1.13
PNP-201ENST00000361505 WIZO95785 1651 aa21.96■■□□□ 1.11
PNP-201ENST00000361505 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.91■■□□□ 1.1
PNP-201ENST00000361505 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PNP-201ENST00000361505 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PNP-201ENST00000361505 SMARCA2P51531 1590 aa21.75■■□□□ 1.07
PNP-201ENST00000361505 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.71■■□□□ 1.07
PNP-201ENST00000361505 HMGXB3Q12766 1538 aa21.59■■□□□ 1.05
PNP-201ENST00000361505 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PNP-201ENST00000361505 NCAPD3P42695 1498 aa21.57■■□□□ 1.04
PNP-201ENST00000361505 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.49■■□□□ 1.03
PNP-201ENST00000361505 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.48■■□□□ 1.03
PNP-201ENST00000361505 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.33■■□□□ 1
PNP-201ENST00000361505 PRDM2Q13029 1718 aa21.1■□□□□ 0.97
PNP-201ENST00000361505 CFTRP13569 1480 aa21.07■□□□□ 0.96
PNP-201ENST00000361505 ABCC8Q09428 1581 aa20.99■□□□□ 0.95
PNP-201ENST00000361505 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.96■□□□□ 0.95
PNP-201ENST00000361505 TRIM41Q8WV44 630 aa20.94■□□□□ 0.94
PNP-201ENST00000361505 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.94■□□□□ 0.94
PNP-201ENST00000361505 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.94
PNP-201ENST00000361505 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.88■□□□□ 0.93
PNP-201ENST00000361505 SYNJ1O43426 1573 aa20.84■□□□□ 0.93
PNP-201ENST00000361505 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.83■□□□□ 0.92
PNP-201ENST00000361505 TOP2BQ02880 1626 aa20.81■□□□□ 0.92
PNP-201ENST00000361505 NESP48681 1621 aa20.76■□□□□ 0.91
PNP-201ENST00000361505 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.73■□□□□ 0.91
PNP-201ENST00000361505 CUX1P39880 1505 aa20.72■□□□□ 0.91
PNP-201ENST00000361505 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.64■□□□□ 0.89
PNP-201ENST00000361505 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.62■□□□□ 0.89
PNP-201ENST00000361505 EEA1Q15075 1411 aa20.62■□□□□ 0.89
PNP-201ENST00000361505 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.61■□□□□ 0.89
PNP-201ENST00000361505 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.6■□□□□ 0.89
PNP-201ENST00000361505 SOGA1O94964 1423 aa20.56■□□□□ 0.88
PNP-201ENST00000361505 TOPBP1Q92547 1522 aa20.53■□□□□ 0.88
PNP-201ENST00000361505 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.49■□□□□ 0.87
PNP-201ENST00000361505 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PNP-201ENST00000361505 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.48■□□□□ 0.87
PNP-201ENST00000361505 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PNP-201ENST00000361505 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PNP-201ENST00000361505 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.41■□□□□ 0.86
PNP-201ENST00000361505 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.41■□□□□ 0.86
PNP-201ENST00000361505 KIF21BO75037 1637 aa20.39■□□□□ 0.85
PNP-201ENST00000361505 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.38■□□□□ 0.85
PNP-201ENST00000361505 WDR97A6NE52 1622 aa20.38■□□□□ 0.85
PNP-201ENST00000361505 KIF27Q86VH2 1401 aa20.37■□□□□ 0.85
PNP-201ENST00000361505 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.36■□□□□ 0.85
PNP-201ENST00000361505 WDR62O43379 1518 aa20.35■□□□□ 0.85
PNP-201ENST00000361505 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PNP-201ENST00000361505 CUX2O14529 1486 aa20.31■□□□□ 0.84
PNP-201ENST00000361505 GOLGA3Q08378 1498 aa20.29■□□□□ 0.84
PNP-201ENST00000361505 ERCC6Q03468 1493 aa20.29■□□□□ 0.84
PNP-201ENST00000361505 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.28■□□□□ 0.84
PNP-201ENST00000361505 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PNP-201ENST00000361505 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.26■□□□□ 0.83
PNP-201ENST00000361505 PRXQ9BXM0 1461 aa20.26■□□□□ 0.83
PNP-201ENST00000361505 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.23■□□□□ 0.83
PNP-201ENST00000361505 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.2■□□□□ 0.82
PNP-201ENST00000361505 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.18■□□□□ 0.82
PNP-201ENST00000361505 IGF1RP08069 1367 aa20.17■□□□□ 0.82
PNP-201ENST00000361505 IFT140Q96RY7 1462 aa20.15■□□□□ 0.82
PNP-201ENST00000361505 CUL7Q14999 1698 aa20.15■□□□□ 0.82
PNP-201ENST00000361505 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.1■□□□□ 0.81
PNP-201ENST00000361505 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.09■□□□□ 0.81
PNP-201ENST00000361505 PBRM1Q86U86 1689 aa20.09■□□□□ 0.81
PNP-201ENST00000361505 CEP162Q5TB80 1403 aa20.06■□□□□ 0.8
PNP-201ENST00000361505 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.06■□□□□ 0.8
PNP-201ENST00000361505 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PNP-201ENST00000361505 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PNP-201ENST00000361505 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PNP-201ENST00000361505 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PNP-201ENST00000361505 GRIN2BQ13224 1484 aa19.98■□□□□ 0.79
PNP-201ENST00000361505 ADAMTS12P58397 1594 aa19.96■□□□□ 0.79
PNP-201ENST00000361505 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.788e-7■■■□□ 18.7
PNP-201ENST00000361505 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.93■□□□□ 0.78
PNP-201ENST00000361505 CLIP1P30622 1438 aa19.92■□□□□ 0.78
PNP-201ENST00000361505 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.9■□□□□ 0.78
PNP-201ENST00000361505 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PNP-201ENST00000361505 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.82■□□□□ 0.76
PNP-201ENST00000361505 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.77■□□□□ 0.76
PNP-201ENST00000361505 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.77■□□□□ 0.76
PNP-201ENST00000361505 ARAP1Q96P48 1450 aa19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms