RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.41■■■■■ 6.46
SRRT-218ENST00000620394 ABCC9O60706 1549 aa50.31■■■■■ 5.65
SRRT-218ENST00000620394 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.1■■■■■ 5.61
SRRT-218ENST00000620394 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.82■■■■■ 5.25
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.45■■■■■ 5.19
SRRT-218ENST00000620394 NACADO15069 1562 aa47.38■■■■■ 5.18
SRRT-218ENST00000620394 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.78■■■■■ 5.08
SRRT-218ENST00000620394 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.71■■■■■ 5.07
SRRT-218ENST00000620394 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.63■■■■■ 5.06
SRRT-218ENST00000620394 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.61■■■■■ 5.05
SRRT-218ENST00000620394 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.39■■■■■ 5.02
SRRT-218ENST00000620394 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
SRRT-218ENST00000620394 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.87■■■■■ 4.93
SRRT-218ENST00000620394 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.82■■■■■ 4.93
SRRT-218ENST00000620394 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.52■■■■■ 4.88
SRRT-218ENST00000620394 SCRIBQ14160 1630 aa45.48■■■■■ 4.87
SRRT-218ENST00000620394 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.42■■■■■ 4.86
SRRT-218ENST00000620394 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.85
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.99■■■■■ 4.63
SRRT-218ENST00000620394 CUX2O14529 1486 aa43.68■■■■■ 4.58
SRRT-218ENST00000620394 NCAPD3P42695 1498 aa43.67■■■■■ 4.58
SRRT-218ENST00000620394 ERCC6Q03468 1493 aa43.53■■■■■ 4.56
SRRT-218ENST00000620394 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.46■■■■■ 4.55
SRRT-218ENST00000620394 HMGXB3Q12766 1538 aa43.42■■■■■ 4.54
SRRT-218ENST00000620394 SMARCA2P51531 1590 aa43.41■■■■■ 4.54
SRRT-218ENST00000620394 SMARCA4P51532 1647 aa43.38■■■■■ 4.54
SRRT-218ENST00000620394 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
SRRT-218ENST00000620394 NESP48681 1621 aa43.08■■■■■ 4.49
SRRT-218ENST00000620394 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
SRRT-218ENST00000620394 PEG3Q9GZU2 1588 aa43■■■■■ 4.47
SRRT-218ENST00000620394 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
SRRT-218ENST00000620394 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.85■■■■■ 4.45
SRRT-218ENST00000620394 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.65■■■■■ 4.42
SRRT-218ENST00000620394 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.65■■■■■ 4.42
SRRT-218ENST00000620394 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.53■■■■■ 4.4
SRRT-218ENST00000620394 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.28■■■■■ 4.36
SRRT-218ENST00000620394 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.23■■■■■ 4.35
SRRT-218ENST00000620394 WDR62O43379 1518 aa42.2■■■■■ 4.35
SRRT-218ENST00000620394 WIZO95785 1651 aa42.15■■■■■ 4.34
SRRT-218ENST00000620394 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.98■■■■■ 4.31
SRRT-218ENST00000620394 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.85■■■■■ 4.29
SRRT-218ENST00000620394 TRIM41Q8WV44 630 aa41.83■■■■■ 4.29
SRRT-218ENST00000620394 CFTRP13569 1480 aa41.75■■■■■ 4.27
SRRT-218ENST00000620394 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
SRRT-218ENST00000620394 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.26
SRRT-218ENST00000620394 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
SRRT-218ENST00000620394 PRDM2Q13029 1718 aa41.49■■■■■ 4.23
SRRT-218ENST00000620394 OSCARQ8IYS5 282 aa41.42■■■■■ 4.22
SRRT-218ENST00000620394 IFT140Q96RY7 1462 aa41.14■■■■■ 4.18
SRRT-218ENST00000620394 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
SRRT-218ENST00000620394 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
SRRT-218ENST00000620394 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
SRRT-218ENST00000620394 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.06■■■■■ 4.16
SRRT-218ENST00000620394 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
SRRT-218ENST00000620394 TOPBP1Q92547 1522 aa41.02■■■■■ 4.16
SRRT-218ENST00000620394 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
SRRT-218ENST00000620394 ABCC8Q09428 1581 aa40.93■■■■■ 4.14
SRRT-218ENST00000620394 ARHGEF11O15085 1522 aa40.9■■■■■ 4.14
SRRT-218ENST00000620394 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.88■■■■■ 4.13
SRRT-218ENST00000620394 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
SRRT-218ENST00000620394 CHD1O14646 1710 aa40.72■■■■■ 4.11
SRRT-218ENST00000620394 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.58■■■■■ 4.092e-9■■■■□ 22
SRRT-218ENST00000620394 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
SRRT-218ENST00000620394 ARAP1Q96P48 1450 aa40.45■■■■■ 4.07
SRRT-218ENST00000620394 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.44■■■■■ 4.06
SRRT-218ENST00000620394 WDR97A6NE52 1622 aa40.39■■■■■ 4.06
SRRT-218ENST00000620394 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.34■■■■■ 4.05
SRRT-218ENST00000620394 FBLN2P98095 1184 aa40.34■■■■■ 4.05
SRRT-218ENST00000620394 SOGA1O94964 1423 aa40.29■■■■■ 4.04
SRRT-218ENST00000620394 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.25■■■■■ 4.03
SRRT-218ENST00000620394 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.24■■■■■ 4.03
SRRT-218ENST00000620394 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
SRRT-218ENST00000620394 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.22■■■■■ 4.03
SRRT-218ENST00000620394 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
SRRT-218ENST00000620394 SYNJ1O43426 1573 aa40.17■■■■■ 4.02
SRRT-218ENST00000620394 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
SRRT-218ENST00000620394 CUX1P39880 1505 aa40.12■■■■■ 4.01
SRRT-218ENST00000620394 GRIN2BQ13224 1484 aa40.07■■■■■ 4.01
SRRT-218ENST00000620394 SYNJ2O15056 1496 aa40.02■■■■■ 4
SRRT-218ENST00000620394 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
SRRT-218ENST00000620394 PBRM1Q86U86 1689 aa39.99■■■■□ 3.99
SRRT-218ENST00000620394 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.85■■■■□ 3.97
SRRT-218ENST00000620394 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.83■■■■□ 3.97
SRRT-218ENST00000620394 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
SRRT-218ENST00000620394 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.78■■■■□ 3.96
SRRT-218ENST00000620394 GRIN2AQ12879 1464 aa39.57■■■■□ 3.93
SRRT-218ENST00000620394 ADAMTS12P58397 1594 aa39.56■■■■□ 3.92
SRRT-218ENST00000620394 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.48■■■■□ 3.91
SRRT-218ENST00000620394 CEP170Q5SW79 1584 aa39.47■■■■□ 3.91
SRRT-218ENST00000620394 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.47■■■■□ 3.91
SRRT-218ENST00000620394 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.46■■■■□ 3.91
SRRT-218ENST00000620394 NUP160Q12769 1436 aa39.46■■■■□ 3.91
SRRT-218ENST00000620394 TOP2BQ02880 1626 aa39.41■■■■□ 3.9
SRRT-218ENST00000620394 SHROOM2Q13796 1616 aa39.41■■■■□ 3.9
SRRT-218ENST00000620394 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
SRRT-218ENST00000620394 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.33■■■■□ 3.89
SRRT-218ENST00000620394 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.3■■■■□ 3.88
SRRT-218ENST00000620394 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.12■■■■□ 3.85
SRRT-218ENST00000620394 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
SRRT-218ENST00000620394 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.04■■■■□ 3.84
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