RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474370.1

RP9-203, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene RP9, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-203ENST00000474370 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.47■■■■■ 7.75
RP9-203ENST00000474370 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.92■■■■■ 6.7
RP9-203ENST00000474370 ABCC9O60706 1549 aa56.74■■■■■ 6.67
RP9-203ENST00000474370 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.06■■■■■ 6.24
RP9-203ENST00000474370 NACADO15069 1562 aa53.74■■■■■ 6.19
RP9-203ENST00000474370 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.33■■■■■ 6.13
RP9-203ENST00000474370 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.17■■■■■ 6.1
RP9-203ENST00000474370 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.09■■■■■ 6.09
RP9-203ENST00000474370 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.96■■■■■ 6.07
RP9-203ENST00000474370 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.81■■■■■ 6.04
RP9-203ENST00000474370 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.65■■■■■ 6.02
RP9-203ENST00000474370 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.59■■■■■ 6.01
RP9-203ENST00000474370 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.45■■■■■ 5.99
RP9-203ENST00000474370 SCRIBQ14160 1630 aa51.83■■■■■ 5.89
RP9-203ENST00000474370 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.81■■■■■ 5.88
RP9-203ENST00000474370 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.29■■■■■ 5.8
RP9-203ENST00000474370 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.22■■■■■ 5.79
RP9-203ENST00000474370 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.09■■■■■ 5.77
RP9-203ENST00000474370 NCAPD3P42695 1498 aa49.63■■■■■ 5.54
RP9-203ENST00000474370 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.5■■■■■ 5.51
RP9-203ENST00000474370 SMARCA4P51532 1647 aa49.49■■■■■ 5.51
RP9-203ENST00000474370 SMARCA2P51531 1590 aa49.33■■■■■ 5.49
RP9-203ENST00000474370 HMGXB3Q12766 1538 aa49.29■■■■■ 5.48
RP9-203ENST00000474370 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.23■■■■■ 5.47
RP9-203ENST00000474370 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.05■■■■■ 5.44
RP9-203ENST00000474370 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.98■■■■■ 5.43
RP9-203ENST00000474370 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.93■■■■■ 5.42
RP9-203ENST00000474370 ERCC6Q03468 1493 aa48.91■■■■■ 5.42
RP9-203ENST00000474370 CUX2O14529 1486 aa48.85■■■■■ 5.41
RP9-203ENST00000474370 NESP48681 1621 aa48.82■■■■■ 5.41
RP9-203ENST00000474370 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.67■■■■■ 5.38
RP9-203ENST00000474370 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.47■■■■■ 5.35
RP9-203ENST00000474370 WIZO95785 1651 aa48.34■■■■■ 5.33
RP9-203ENST00000474370 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
RP9-203ENST00000474370 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.21■■■■■ 5.31
RP9-203ENST00000474370 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.13■■■■■ 5.3
RP9-203ENST00000474370 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.09■■■■■ 5.29
RP9-203ENST00000474370 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.94■■■■■ 5.26
RP9-203ENST00000474370 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.75■■■■■ 5.23
RP9-203ENST00000474370 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
RP9-203ENST00000474370 WDR62O43379 1518 aa47.67■■■■■ 5.22
RP9-203ENST00000474370 CFTRP13569 1480 aa47.6■■■■■ 5.21
RP9-203ENST00000474370 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.57■■■■■ 5.21
RP9-203ENST00000474370 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.54■■■■■ 5.2
RP9-203ENST00000474370 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
RP9-203ENST00000474370 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.18■■■■■ 5.14
RP9-203ENST00000474370 PRDM2Q13029 1718 aa47.18■■■■■ 5.14
RP9-203ENST00000474370 TOPBP1Q92547 1522 aa46.69■■■■■ 5.06
RP9-203ENST00000474370 IFT140Q96RY7 1462 aa46.63■■■■■ 5.05
RP9-203ENST00000474370 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
RP9-203ENST00000474370 OSCARQ8IYS5 282 aa46.57■■■■■ 5.05
RP9-203ENST00000474370 ABCC8Q09428 1581 aa46.54■■■■■ 5.04
RP9-203ENST00000474370 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.52■■■■■ 5.04
RP9-203ENST00000474370 TRIM41Q8WV44 630 aa46.5■■■■■ 5.03
RP9-203ENST00000474370 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
RP9-203ENST00000474370 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5
RP9-203ENST00000474370 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.23■■■■■ 4.99
RP9-203ENST00000474370 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.15■■■■■ 4.982e-6■■■■□ 21
RP9-203ENST00000474370 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.06■■■■■ 4.96
RP9-203ENST00000474370 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.06■■■■■ 4.96
RP9-203ENST00000474370 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.06■■■■■ 4.96
RP9-203ENST00000474370 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.05■■■■■ 4.96
RP9-203ENST00000474370 CHD1O14646 1710 aa45.97■■■■■ 4.95
RP9-203ENST00000474370 SOGA1O94964 1423 aa45.96■■■■■ 4.95
RP9-203ENST00000474370 CUX1P39880 1505 aa45.95■■■■■ 4.95
RP9-203ENST00000474370 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.93■■■■■ 4.94
RP9-203ENST00000474370 ARHGEF11O15085 1522 aa45.91■■■■■ 4.94
RP9-203ENST00000474370 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
RP9-203ENST00000474370 WDR97A6NE52 1622 aa45.8■■■■■ 4.92
RP9-203ENST00000474370 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
RP9-203ENST00000474370 FBLN2P98095 1184 aa45.7■■■■■ 4.91
RP9-203ENST00000474370 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.68■■■■■ 4.9
RP9-203ENST00000474370 GRIN2BQ13224 1484 aa45.56■■■■■ 4.88
RP9-203ENST00000474370 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.56■■■■■ 4.88
RP9-203ENST00000474370 ARAP1Q96P48 1450 aa45.49■■■■■ 4.87
RP9-203ENST00000474370 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.47■■■■■ 4.87
RP9-203ENST00000474370 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.47■■■■■ 4.87
RP9-203ENST00000474370 PBRM1Q86U86 1689 aa45.44■■■■■ 4.87
RP9-203ENST00000474370 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.44■■■■■ 4.86
RP9-203ENST00000474370 SYNJ2O15056 1496 aa45.42■■■■■ 4.86
RP9-203ENST00000474370 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.42■■■■■ 4.86
RP9-203ENST00000474370 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
RP9-203ENST00000474370 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.4■■■■■ 4.86
RP9-203ENST00000474370 SYNJ1O43426 1573 aa45.37■■■■■ 4.85
RP9-203ENST00000474370 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.26■■■■■ 4.84
RP9-203ENST00000474370 TOP2BQ02880 1626 aa45.25■■■■■ 4.83
RP9-203ENST00000474370 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.22■■■■■ 4.83
RP9-203ENST00000474370 ADAMTS12P58397 1594 aa45.02■■■■■ 4.8
RP9-203ENST00000474370 GRIN2AQ12879 1464 aa45■■■■■ 4.79
RP9-203ENST00000474370 CEP170Q5SW79 1584 aa44.87■■■■■ 4.77
RP9-203ENST00000474370 NUP160Q12769 1436 aa44.87■■■■■ 4.77
RP9-203ENST00000474370 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
RP9-203ENST00000474370 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.85■■■■■ 4.77
RP9-203ENST00000474370 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.84■■■■■ 4.77
RP9-203ENST00000474370 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.78■■■■■ 4.76
RP9-203ENST00000474370 SHROOM2Q13796 1616 aa44.69■■■■■ 4.74
RP9-203ENST00000474370 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.4■■■■■ 4.7
RP9-203ENST00000474370 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
RP9-203ENST00000474370 JPH4Q96JJ6 628 aa44.33■■■■■ 4.69
RP9-203ENST00000474370 IGF1RP08069 1367 aa44.31■■■■■ 4.68
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