RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474214.2

RUBCN-210, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene RUBCN, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCN-210ENST00000474214 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.04■■■■■ 6.4
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RUBCN-210ENST00000474214 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.56■■■■■ 4.88
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RUBCN-210ENST00000474214 SCRIBQ14160 1630 aa44.78■■■■■ 4.76
RUBCN-210ENST00000474214 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.69■■■■■ 4.74
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RUBCN-210ENST00000474214 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.03■■■■■ 4.64
RUBCN-210ENST00000474214 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.79■■■■■ 4.6
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RUBCN-210ENST00000474214 SMARCA4P51532 1647 aa42.83■■■■■ 4.45
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RUBCN-210ENST00000474214 SMARCA2P51531 1590 aa42.64■■■■■ 4.42
RUBCN-210ENST00000474214 HMGXB3Q12766 1538 aa42.56■■■■■ 4.4
RUBCN-210ENST00000474214 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.48■■■■■ 4.39
RUBCN-210ENST00000474214 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.41■■■■■ 4.38
RUBCN-210ENST00000474214 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
RUBCN-210ENST00000474214 NESP48681 1621 aa41.97■■■■■ 4.31
RUBCN-210ENST00000474214 ERCC6Q03468 1493 aa41.92■■■■■ 4.3
RUBCN-210ENST00000474214 WIZO95785 1651 aa41.91■■■■■ 4.3
RUBCN-210ENST00000474214 CUX2O14529 1486 aa41.79■■■■■ 4.28
RUBCN-210ENST00000474214 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.77■■■■■ 4.28
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RUBCN-210ENST00000474214 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.51■■■■■ 4.24
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RUBCN-210ENST00000474214 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.46■■■■■ 4.23
RUBCN-210ENST00000474214 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
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RUBCN-210ENST00000474214 CFTRP13569 1480 aa41.18■■■■■ 4.18
RUBCN-210ENST00000474214 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.09■■■■■ 4.17
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RUBCN-210ENST00000474214 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.02■■■■■ 4.16
RUBCN-210ENST00000474214 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.01■■■■■ 4.16
RUBCN-210ENST00000474214 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.94■■■■■ 4.14
RUBCN-210ENST00000474214 PRDM2Q13029 1718 aa40.83■■■■■ 4.13
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RUBCN-210ENST00000474214 ABCC8Q09428 1581 aa40.25■■■■■ 4.03
RUBCN-210ENST00000474214 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.22■■■■■ 4.03
RUBCN-210ENST00000474214 IFT140Q96RY7 1462 aa40.19■■■■■ 4.03
RUBCN-210ENST00000474214 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
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RUBCN-210ENST00000474214 OSCARQ8IYS5 282 aa39.9■■■■□ 3.98
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RUBCN-210ENST00000474214 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.74■■■■□ 3.95
RUBCN-210ENST00000474214 SOGA1O94964 1423 aa39.73■■■■□ 3.95
RUBCN-210ENST00000474214 WDR97A6NE52 1622 aa39.6■■■■□ 3.93
RUBCN-210ENST00000474214 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
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RUBCN-210ENST00000474214 TRIM41Q8WV44 630 aa39.46■■■■□ 3.91
RUBCN-210ENST00000474214 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
RUBCN-210ENST00000474214 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
RUBCN-210ENST00000474214 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
RUBCN-210ENST00000474214 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.37■■■■□ 3.89
RUBCN-210ENST00000474214 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.35■■■■□ 3.89
RUBCN-210ENST00000474214 GRIN2BQ13224 1484 aa39.35■■■■□ 3.89
RUBCN-210ENST00000474214 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.32■■■■□ 3.89
RUBCN-210ENST00000474214 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
RUBCN-210ENST00000474214 TOP2BQ02880 1626 aa39.31■■■■□ 3.88
RUBCN-210ENST00000474214 ARHGEF11O15085 1522 aa39.3■■■■□ 3.88
RUBCN-210ENST00000474214 FBLN2P98095 1184 aa39.28■■■■□ 3.88
RUBCN-210ENST00000474214 SYNJ1O43426 1573 aa39.27■■■■□ 3.88
RUBCN-210ENST00000474214 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.27■■■■□ 3.88
RUBCN-210ENST00000474214 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.27■■■■□ 3.88
RUBCN-210ENST00000474214 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.27■■■■□ 3.88
RUBCN-210ENST00000474214 PBRM1Q86U86 1689 aa39.25■■■■□ 3.87
RUBCN-210ENST00000474214 SYNJ2O15056 1496 aa39.17■■■■□ 3.86
RUBCN-210ENST00000474214 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
RUBCN-210ENST00000474214 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.12■■■■□ 3.85
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RUBCN-210ENST00000474214 SHROOM2Q13796 1616 aa38.56■■■■□ 3.76
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RUBCN-210ENST00000474214 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.36■■■■□ 3.73
RUBCN-210ENST00000474214 JPH4Q96JJ6 628 aa38.28■■■■□ 3.72
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