RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568693.1

E2F4-211, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 2

Gene E2F4, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-211	ENST00000568693	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		19.34	■□□□□ 0.69
E2F4-211	ENST00000568693	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
E2F4-211	ENST00000568693	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		18.7	■□□□□ 0.58
E2F4-211	ENST00000568693	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		17.01	■□□□□ 0.31
E2F4-211	ENST00000568693	ABCC9	O60706	1549 aa		16.65	■□□□□ 0.26
E2F4-211	ENST00000568693	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	16.47	■□□□□ 0.23
E2F4-211	ENST00000568693	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	16.23	■□□□□ 0.19
E2F4-211	ENST00000568693	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		16.05	■□□□□ 0.16
E2F4-211	ENST00000568693	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		15.95	■□□□□ 0.14
E2F4-211	ENST00000568693	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		15.94	■□□□□ 0.14
E2F4-211	ENST00000568693	NACAD	O15069	1562 aa		15.88	■□□□□ 0.13
E2F4-211	ENST00000568693	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		15.88	■□□□□ 0.13
E2F4-211	ENST00000568693	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
E2F4-211	ENST00000568693	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		15.63	■□□□□ 0.09
E2F4-211	ENST00000568693	SCRIB	Q14160	1630 aa		15.54	■□□□□ 0.08
E2F4-211	ENST00000568693	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	15.51	■□□□□ 0.07
E2F4-211	ENST00000568693	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		15.5	■□□□□ 0.07
E2F4-211	ENST00000568693	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		15.49	■□□□□ 0.07
E2F4-211	ENST00000568693	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		15.48	■□□□□ 0.07
E2F4-211	ENST00000568693	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		15.37	■□□□□ 0.05
E2F4-211	ENST00000568693	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
E2F4-211	ENST00000568693	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		15.07	■□□□□ 0
E2F4-211	ENST00000568693	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		14.99	□□□□□ -0.01
E2F4-211	ENST00000568693	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
E2F4-211	ENST00000568693	SMARCA4	P51532	1647 aa		14.92	□□□□□ -0.02
E2F4-211	ENST00000568693	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		14.9	□□□□□ -0.02
E2F4-211	ENST00000568693	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
E2F4-211	ENST00000568693	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
E2F4-211	ENST00000568693	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		14.78	□□□□□ -0.04
E2F4-211	ENST00000568693	WIZ	O95785	1651 aa		14.75	□□□□□ -0.05
E2F4-211	ENST00000568693	SMARCA2	P51531	1590 aa		14.73	□□□□□ -0.05
E2F4-211	ENST00000568693	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		14.71	□□□□□ -0.05
E2F4-211	ENST00000568693	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
E2F4-211	ENST00000568693	NCAPD3	P42695	1498 aa		14.64	□□□□□ -0.07
E2F4-211	ENST00000568693	HMGXB3	Q12766	1538 aa		14.64	□□□□□ -0.07
E2F4-211	ENST00000568693	FOXD1	Q16676	465 aa		14.62	□□□□□ -0.07
E2F4-211	ENST00000568693	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
E2F4-211	ENST00000568693	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		14.45	□□□□□ -0.1
E2F4-211	ENST00000568693	ADRA2B	P18089	450 aa		14.4	□□□□□ -0.1
E2F4-211	ENST00000568693	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		14.39	□□□□□ -0.11
E2F4-211	ENST00000568693	NES	P48681	1621 aa		14.36	□□□□□ -0.11
E2F4-211	ENST00000568693	ERCC6	Q03468	1493 aa		14.35	□□□□□ -0.11
E2F4-211	ENST00000568693	CUX2	O14529	1486 aa		14.3	□□□□□ -0.12
E2F4-211	ENST00000568693	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		14.3	□□□□□ -0.12
E2F4-211	ENST00000568693	CFTR	P13569	1480 aa		14.25	□□□□□ -0.13
E2F4-211	ENST00000568693	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		14.22	□□□□□ -0.13
E2F4-211	ENST00000568693	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		14.2	□□□□□ -0.14
E2F4-211	ENST00000568693	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
E2F4-211	ENST00000568693	PRDM2	Q13029	1718 aa		14.18	□□□□□ -0.14
E2F4-211	ENST00000568693	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		14.18	□□□□□ -0.14
E2F4-211	ENST00000568693	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		14.11	□□□□□ -0.15
E2F4-211	ENST00000568693	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		14.07	□□□□□ -0.16
E2F4-211	ENST00000568693	ABCC8	Q09428	1581 aa		14.06	□□□□□ -0.16
E2F4-211	ENST00000568693	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		14.06	□□□□□ -0.16
E2F4-211	ENST00000568693	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	14.03	□□□□□ -0.16
E2F4-211	ENST00000568693	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		14.03	□□□□□ -0.16
E2F4-211	ENST00000568693	WDR62	O43379	1518 aa		14.03	□□□□□ -0.16
E2F4-211	ENST00000568693	SYNJ1	O43426	1573 aa		13.99	□□□□□ -0.17
E2F4-211	ENST00000568693	TOP2B	Q02880	1626 aa		13.97	□□□□□ -0.17
E2F4-211	ENST00000568693	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		13.97	□□□□□ -0.17
E2F4-211	ENST00000568693	CUX1	P39880	1505 aa		13.96	□□□□□ -0.17
E2F4-211	ENST00000568693	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.95	□□□□□ -0.18
E2F4-211	ENST00000568693	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		13.93	□□□□□ -0.18
E2F4-211	ENST00000568693	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
E2F4-211	ENST00000568693	TOPBP1	Q92547	1522 aa		13.9	□□□□□ -0.19
E2F4-211	ENST00000568693	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
E2F4-211	ENST00000568693	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		13.84	□□□□□ -0.19
E2F4-211	ENST00000568693	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
E2F4-211	ENST00000568693	SOGA1	O94964	1423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
E2F4-211	ENST00000568693	EEA1	Q15075	1411 aa		13.75	□□□□□ -0.21
E2F4-211	ENST00000568693	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		13.74	□□□□□ -0.21
E2F4-211	ENST00000568693	IFT140	Q96RY7	1462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
E2F4-211	ENST00000568693	WDR97	A6NE52	1622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
E2F4-211	ENST00000568693	KCNA4	P22459	653 aa		13.73	□□□□□ -0.21
E2F4-211	ENST00000568693	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		13.73	□□□□□ -0.21
E2F4-211	ENST00000568693	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
E2F4-211	ENST00000568693	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
E2F4-211	ENST00000568693	KIF27	Q86VH2	1401 aa		13.71	□□□□□ -0.22
E2F4-211	ENST00000568693	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		13.69	□□□□□ -0.22
E2F4-211	ENST00000568693	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		13.66	□□□□□ -0.22
E2F4-211	ENST00000568693	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		13.66	□□□□□ -0.22
E2F4-211	ENST00000568693	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
E2F4-211	ENST00000568693	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
E2F4-211	ENST00000568693	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-211	ENST00000568693	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23	1e-8	■■■■■ 34
E2F4-211	ENST00000568693	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		13.61	□□□□□ -0.23
E2F4-211	ENST00000568693	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
E2F4-211	ENST00000568693	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
E2F4-211	ENST00000568693	KIF21B	O75037	1637 aa		13.58	□□□□□ -0.24
E2F4-211	ENST00000568693	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.58	□□□□□ -0.24
E2F4-211	ENST00000568693	IGF1R	P08069	1367 aa		13.58	□□□□□ -0.24
E2F4-211	ENST00000568693	PRX	Q9BXM0	1461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
E2F4-211	ENST00000568693	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.56	□□□□□ -0.24
E2F4-211	ENST00000568693	CUL7	Q14999	1698 aa		13.55	□□□□□ -0.24
E2F4-211	ENST00000568693	CHD1	O14646	1710 aa		13.55	□□□□□ -0.24
E2F4-211	ENST00000568693	GRIN2B	Q13224	1484 aa		13.55	□□□□□ -0.24
E2F4-211	ENST00000568693	GOLGA3	Q08378	1498 aa		13.53	□□□□□ -0.24
E2F4-211	ENST00000568693	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		13.5	□□□□□ -0.25
E2F4-211	ENST00000568693	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		13.5	□□□□□ -0.25
E2F4-211	ENST00000568693	ADAMTS12	P58397	1594 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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