Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 TPST2-205ENST00000442495 586 ntTSL 224.44■■□□□ 1.52e-8■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 TPST2-207ENST00000450022 544 ntTSL 322.86■■□□□ 1.252e-8■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 TPST2-204ENST00000440953 544 ntTSL 520.32■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 WDR1-217ENST00000515018 274 ntTSL 39.09□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 WDR1-201ENST00000264785 549 ntTSL 48.3□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.44■■■□□ 2.461e-8■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.544e-8■■■■■ 42.7
GTF2F1P35269 NSUN2-203ENST00000504374 3217 ntTSL 219.98■□□□□ 0.794e-8■■■■■ 42.7
GTF2F1P35269 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 42.7
GTF2F1P35269 NSUN2-208ENST00000513888 1290 ntTSL 217.25■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 42.7
GTF2F1P35269 NSUN2-205ENST00000505892 3558 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.954e-8■■■■■ 42.7
GTF2F1P35269 NSUN2-209ENST00000514127 614 ntTSL 35.3□□□□□ -1.564e-8■■■■■ 42.7
GTF2F1P35269 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.411e-9■■■■■ 42.7
GTF2F1P35269 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.761e-9■■■■■ 42.7
GTF2F1P35269 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.13e-14■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.893e-14■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.613e-14■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.583e-14■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PEPD-212ENST00000593163 1045 ntTSL 220.56■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PEPD-204ENST00000588328 581 ntTSL 315.34■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PEPD-213ENST00000609145 570 ntTSL 211.21□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 310.29□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 48.85□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 HPN-204ENST00000593305 2175 ntTSL 223.65■■□□□ 1.387e-12■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PLEKHA2-203ENST00000519640 565 ntTSL 522.3■■□□□ 1.167e-9■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.927e-9■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 HPN-203ENST00000541345 1820 ntTSL 219■□□□□ 0.637e-12■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.47e-9■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.057e-9■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.127e-9■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 CTBP1-210ENST00000510739 774 ntTSL 317.88■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 CTBP1-206ENST00000504784 418 ntTSL 315.49■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 42.6
GTF2F1P35269 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 321.9■■□□□ 1.17e-7■■■■■ 42.5
GTF2F1P35269 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 42.5
GTF2F1P35269 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 42.5
GTF2F1P35269 SPTB-206ENST00000553938 3456 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 42.4
GTF2F1P35269 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 42.4
GTF2F1P35269 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 42.4
GTF2F1P35269 R3HDM4-207ENST00000591829 823 ntTSL 514.72□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 42.4
GTF2F1P35269 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)30.28■■■□□ 2.443e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.273e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.263e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.153e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.133e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)28.36■■■□□ 2.133e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.083e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.083e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.083e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.083e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.083e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.083e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.083e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.083e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.83e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 223.89■■□□□ 1.413e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.393e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.873e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.83e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.773e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.163e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 515.61■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.183e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.683e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-10■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-222ENST00000630907 889 ntTSL 527.83■■■□□ 2.056e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-208ENST00000625681 654 ntTSL 526.13■■□□□ 1.776e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-213ENST00000626793 733 ntTSL 526.13■■□□□ 1.776e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-218ENST00000629252 1112 ntTSL 523.33■■□□□ 1.336e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-215ENST00000628267 779 ntTSL 523■■□□□ 1.276e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-214ENST00000627018 474 ntTSL 322.32■■□□□ 1.166e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.786e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.46e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.346e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.236e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.126e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.16e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.086e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.046e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.066e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.296e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-219ENST00000629886 436 ntTSL 35.87□□□□□ -1.476e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.486e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.646e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 UBE3A-216ENST00000628733 706 ntTSL 53.95□□□□□ -1.786e-11■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -14e-7■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 SEPT9-245ENST00000592481 1291 ntTSL 521.68■■□□□ 1.064e-7■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 SEPT9-221ENST00000588958 879 ntTSL 217.67■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 SEPT9-212ENST00000586128 752 ntTSL 415.74■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 42.3
GTF2F1P35269 SEPT9-239ENST00000591704 749 ntTSL 213.17□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 42.3
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 226.6 ms