Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3BP5O60239 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3BP5O60239 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5O60239 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms