Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX2-6A6NCS4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-6A6NCS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-6A6NCS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-6A6NCS4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-6A6NCS4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-6A6NCS4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-6A6NCS4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms