Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C5orf47Q569G3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms