RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343702.8

NTN4-201, Transcript of netrin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN4, Length 3,615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4-201ENST00000343702 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.88■■□□□ 1.89
NTN4-201ENST00000343702 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.81■■□□□ 1.56
NTN4-201ENST00000343702 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.79■■□□□ 1.56
NTN4-201ENST00000343702 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NTN4-201ENST00000343702 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.96■■□□□ 1.43
NTN4-201ENST00000343702 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
NTN4-201ENST00000343702 HRCP23327 699 aa23.66■■□□□ 1.38
NTN4-201ENST00000343702 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.41■■□□□ 1.34
NTN4-201ENST00000343702 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.33■■□□□ 1.32
NTN4-201ENST00000343702 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.21■■□□□ 1.31
NTN4-201ENST00000343702 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.07■■□□□ 1.28
NTN4-201ENST00000343702 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NTN4-201ENST00000343702 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NTN4-201ENST00000343702 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NTN4-201ENST00000343702 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NTN4-201ENST00000343702 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NTN4-201ENST00000343702 TRIM41Q8WV44 630 aa22.5■■□□□ 1.19
NTN4-201ENST00000343702 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NTN4-201ENST00000343702 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NTN4-201ENST00000343702 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NTN4-201ENST00000343702 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
NTN4-201ENST00000343702 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NTN4-201ENST00000343702 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.12■■□□□ 1.13
NTN4-201ENST00000343702 NEUROD1Q13562 356 aa22.09■■□□□ 1.13
NTN4-201ENST00000343702 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.07■■□□□ 1.12
NTN4-201ENST00000343702 ABCC9O60706 1549 aa22.06■■□□□ 1.12
NTN4-201ENST00000343702 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NTN4-201ENST00000343702 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.99■■□□□ 1.11
NTN4-201ENST00000343702 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NTN4-201ENST00000343702 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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NTN4-201ENST00000343702 SCRIBQ14160 1630 aa21.87■■□□□ 1.09
NTN4-201ENST00000343702 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
NTN4-201ENST00000343702 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.07
NTN4-201ENST00000343702 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
NTN4-201ENST00000343702 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NTN4-201ENST00000343702 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.46■■□□□ 1.03
NTN4-201ENST00000343702 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.45■■□□□ 1.02
NTN4-201ENST00000343702 MYT1Q01538 1121 aa21.37■■□□□ 1.01
NTN4-201ENST00000343702 APLP2Q06481 763 aa21.37■■□□□ 1.01
NTN4-201ENST00000343702 MIER1Q8N108 512 aa21.33■■□□□ 1
NTN4-201ENST00000343702 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
NTN4-201ENST00000343702 BCANQ96GW7 911 aa21.23■□□□□ 0.99
NTN4-201ENST00000343702 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.16■□□□□ 0.98
NTN4-201ENST00000343702 ITGAEP38570 1179 aa21.15■□□□□ 0.98
NTN4-201ENST00000343702 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
NTN4-201ENST00000343702 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.09■□□□□ 0.97
NTN4-201ENST00000343702 SOGA1O94964 1423 aa21■□□□□ 0.95
NTN4-201ENST00000343702 ABCC8Q09428 1581 aa20.98■□□□□ 0.95
NTN4-201ENST00000343702 CEP162Q5TB80 1403 aa20.97■□□□□ 0.95
NTN4-201ENST00000343702 WIZO95785 1651 aa20.97■□□□□ 0.95
NTN4-201ENST00000343702 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.95■□□□□ 0.94
NTN4-201ENST00000343702 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.85■□□□□ 0.93
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NTN4-201ENST00000343702 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
NTN4-201ENST00000343702 P3H3Q8IVL6 736 aa20.69■□□□□ 0.9
NTN4-201ENST00000343702 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.68■□□□□ 0.9
NTN4-201ENST00000343702 KCNH8Q96L42 1107 aa20.67■□□□□ 0.9
NTN4-201ENST00000343702 FKBP8Q14318 412 aa20.66■□□□□ 0.9
NTN4-201ENST00000343702 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
NTN4-201ENST00000343702 BCL11AQ9H165 835 aa20.64■□□□□ 0.89
NTN4-201ENST00000343702 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
NTN4-201ENST00000343702 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.62■□□□□ 0.89
NTN4-201ENST00000343702 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.59■□□□□ 0.89
NTN4-201ENST00000343702 CLIP1P30622 1438 aa20.58■□□□□ 0.89
NTN4-201ENST00000343702 NEFLP07196 543 aa20.57■□□□□ 0.88
NTN4-201ENST00000343702 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
NTN4-201ENST00000343702 TRIM52Q96A61 297 aa20.56■□□□□ 0.88
NTN4-201ENST00000343702 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.55■□□□□ 0.88
NTN4-201ENST00000343702 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NTN4-201ENST00000343702 GOLGA3Q08378 1498 aa20.51■□□□□ 0.87
NTN4-201ENST00000343702 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NTN4-201ENST00000343702 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NTN4-201ENST00000343702 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NTN4-201ENST00000343702 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NTN4-201ENST00000343702 ARID3CA6NKF2 412 aa20.38■□□□□ 0.85
NTN4-201ENST00000343702 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NTN4-201ENST00000343702 SMARCA4P51532 1647 aa20.32■□□□□ 0.84
NTN4-201ENST00000343702 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NTN4-201ENST00000343702 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.32■□□□□ 0.84
NTN4-201ENST00000343702 SMARCA2P51531 1590 aa20.31■□□□□ 0.84
NTN4-201ENST00000343702 EEA1Q15075 1411 aa20.31■□□□□ 0.84
NTN4-201ENST00000343702 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.29■□□□□ 0.84
NTN4-201ENST00000343702 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.29■□□□□ 0.84
NTN4-201ENST00000343702 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.27■□□□□ 0.83
NTN4-201ENST00000343702 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
NTN4-201ENST00000343702 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.25■□□□□ 0.83
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NTN4-201ENST00000343702 NBR1Q14596 966 aa20.14■□□□□ 0.81
NTN4-201ENST00000343702 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NTN4-201ENST00000343702 ANP32CO43423 234 aa20.11■□□□□ 0.81
NTN4-201ENST00000343702 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.1■□□□□ 0.81
NTN4-201ENST00000343702 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.1■□□□□ 0.81
NTN4-201ENST00000343702 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
NTN4-201ENST00000343702 SYNJ1O43426 1573 aa20.08■□□□□ 0.8
NTN4-201ENST00000343702 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NTN4-201ENST00000343702 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.04■□□□□ 0.8
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NTN4-201ENST00000343702 KIF21BO75037 1637 aa20■□□□□ 0.79
NTN4-201ENST00000343702 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20■□□□□ 0.79
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