Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF8Q3BBV2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF8Q3BBV2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms