RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.34■■■■■ 4.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.97■■■■□ 3.35
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCC9O60706 1549 aa35.69■■■■□ 3.3
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.07■■■■□ 3.05
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.94■■■■□ 3.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NACADO15069 1562 aa33.94■■■■□ 3.02
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.58■■■□□ 2.97
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.36■■■□□ 2.93
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.33■■■□□ 2.93
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.31■■■□□ 2.92
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.23■■■□□ 2.91
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.13■■■□□ 2.89
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SCRIBQ14160 1630 aa32.86■■■□□ 2.85
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.61■■■□□ 2.81
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.24■■■□□ 2.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.09■■■□□ 2.73
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SMARCA4P51532 1647 aa31.38■■■□□ 2.61
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NCAPD3P42695 1498 aa31.36■■■□□ 2.61
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.33■■■□□ 2.61
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SMARCA2P51531 1590 aa31.21■■■□□ 2.59
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HMGXB3Q12766 1538 aa31.12■■■□□ 2.57
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.12■■■□□ 2.57
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.05■■■□□ 2.56
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NESP48681 1621 aa30.79■■■□□ 2.52
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WIZO95785 1651 aa30.76■■■□□ 2.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ERCC6Q03468 1493 aa30.73■■■□□ 2.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.55■■■□□ 2.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CUX2O14529 1486 aa30.53■■■□□ 2.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.43■■■□□ 2.46
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.38■■■□□ 2.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.36■■■□□ 2.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.16■■■□□ 2.42
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CFTRP13569 1480 aa30.16■■■□□ 2.42
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.09■■■□□ 2.41
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.07■■■□□ 2.4
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.06■■■□□ 2.4
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.04■■■□□ 2.4
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WDR62O43379 1518 aa30.01■■■□□ 2.39
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRDM2Q13029 1718 aa29.85■■■□□ 2.37
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TOPBP1Q92547 1522 aa29.55■■■□□ 2.32
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCC8Q09428 1581 aa29.47■■■□□ 2.31
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.46■■■□□ 2.31
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IFT140Q96RY7 1462 aa29.44■■■□□ 2.3
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OSCARQ8IYS5 282 aa29.26■■■□□ 2.27
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.21■■■□□ 2.27
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.26
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CUX1P39880 1505 aa29.2■■■□□ 2.26
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SOGA1O94964 1423 aa29.16■■■□□ 2.26
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.15■■■□□ 2.26
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRIM41Q8WV44 630 aa29■■■□□ 2.23
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CHD1O14646 1710 aa28.94■■■□□ 2.22
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WDR97A6NE52 1622 aa28.92■■■□□ 2.22
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FBLN2P98095 1184 aa28.92■■■□□ 2.22
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.87■■■□□ 2.21
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GRIN2BQ13224 1484 aa28.84■■■□□ 2.21
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.84■■■□□ 2.21
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.83■■■□□ 2.21
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.83■■■□□ 2.21
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.83■■■□□ 2.21
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SYNJ1O43426 1573 aa28.82■■■□□ 2.2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TOP2BQ02880 1626 aa28.8■■■□□ 2.2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.8■■■□□ 2.2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARHGEF11O15085 1522 aa28.77■■■□□ 2.2
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PBRM1Q86U86 1689 aa28.75■■■□□ 2.19
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.75■■■□□ 2.19
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SYNJ2O15056 1496 aa28.69■■■□□ 2.18
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.62■■■□□ 2.17
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.58■■■□□ 2.17
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARAP1Q96P48 1450 aa28.53■■■□□ 2.16
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADAMTS12P58397 1594 aa28.5■■■□□ 2.15
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GRIN2AQ12879 1464 aa28.47■■■□□ 2.15
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.46■■■□□ 2.15
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.44■■■□□ 2.14
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CEP170Q5SW79 1584 aa28.37■■■□□ 2.13
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NUP160Q12769 1436 aa28.37■■■□□ 2.13
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.26■■■□□ 2.11
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IGF1RP08069 1367 aa28.25■■■□□ 2.11
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIF27Q86VH2 1401 aa28.25■■■□□ 2.11
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SHROOM2Q13796 1616 aa28.19■■■□□ 2.1
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 JPH4Q96JJ6 628 aa28.12■■■□□ 2.09
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CUL7Q14999 1698 aa28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms