Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHDQ02161 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHDQ02161 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHDQ02161 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHDQ02161 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHDQ02161 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHDQ02161 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHDQ02161 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHDQ02161 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHDQ02161 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHDQ02161 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHDQ02161 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHDQ02161 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHDQ02161 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHDQ02161 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHDQ02161 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHDQ02161 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms