RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323482.8

ACSS1-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS1, Length 3,680 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-201ENST00000323482 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.68■■■□□ 2.5
ACSS1-201ENST00000323482 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
ACSS1-201ENST00000323482 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.86■■■□□ 2.05
ACSS1-201ENST00000323482 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.54■■■□□ 2
ACSS1-201ENST00000323482 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
ACSS1-201ENST00000323482 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.18■■□□□ 1.94
ACSS1-201ENST00000323482 HRCP23327 699 aa27.15■■□□□ 1.94
ACSS1-201ENST00000323482 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.85■■□□□ 1.89
ACSS1-201ENST00000323482 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.51■■□□□ 1.83
ACSS1-201ENST00000323482 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.37■■□□□ 1.81
ACSS1-201ENST00000323482 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACSS1-201ENST00000323482 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
ACSS1-201ENST00000323482 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
ACSS1-201ENST00000323482 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.02■■□□□ 1.76
ACSS1-201ENST00000323482 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ACSS1-201ENST00000323482 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ACSS1-201ENST00000323482 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ACSS1-201ENST00000323482 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
ACSS1-201ENST00000323482 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ACSS1-201ENST00000323482 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
ACSS1-201ENST00000323482 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
ACSS1-201ENST00000323482 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.51■■□□□ 1.67
ACSS1-201ENST00000323482 TRIM41Q8WV44 630 aa25.4■■□□□ 1.66
ACSS1-201ENST00000323482 NEUROD1Q13562 356 aa25.39■■□□□ 1.65
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.35■■□□□ 1.65
ACSS1-201ENST00000323482 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
ACSS1-201ENST00000323482 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ACSS1-201ENST00000323482 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ACSS1-201ENST00000323482 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25■■□□□ 1.59
ACSS1-201ENST00000323482 MYT1Q01538 1121 aa24.9■■□□□ 1.58
ACSS1-201ENST00000323482 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ACSS1-201ENST00000323482 SCRIBQ14160 1630 aa24.67■■□□□ 1.54
ACSS1-201ENST00000323482 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ACSS1-201ENST00000323482 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
ACSS1-201ENST00000323482 BCANQ96GW7 911 aa24.5■■□□□ 1.51
ACSS1-201ENST00000323482 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ACSS1-201ENST00000323482 MIER1Q8N108 512 aa24.47■■□□□ 1.51
ACSS1-201ENST00000323482 ABCC9O60706 1549 aa24.44■■□□□ 1.5
ACSS1-201ENST00000323482 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.43■■□□□ 1.5
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ACSS1-201ENST00000323482 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.29■■□□□ 1.48
ACSS1-201ENST00000323482 APLP2Q06481 763 aa24.21■■□□□ 1.47
ACSS1-201ENST00000323482 ITGAEP38570 1179 aa24.12■■□□□ 1.45
ACSS1-201ENST00000323482 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.07■■□□□ 1.44
ACSS1-201ENST00000323482 WIZO95785 1651 aa23.93■■□□□ 1.42
ACSS1-201ENST00000323482 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.92■■□□□ 1.42
ACSS1-201ENST00000323482 BCL11AQ9H165 835 aa23.91■■□□□ 1.42
ACSS1-201ENST00000323482 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ACSS1-201ENST00000323482 NEFLP07196 543 aa23.81■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 FKBP8Q14318 412 aa23.81■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.78■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.78■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 ABCC8Q09428 1581 aa23.77■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.73■■□□□ 1.39
ACSS1-201ENST00000323482 SOGA1O94964 1423 aa23.71■■□□□ 1.39
ACSS1-201ENST00000323482 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.7■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 CEP162Q5TB80 1403 aa23.67■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 NACADO15069 1562 aa23.65■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 KCNH8Q96L42 1107 aa23.65■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 TRIM52Q96A61 297 aa23.65■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ACSS1-201ENST00000323482 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ACSS1-201ENST00000323482 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.57■■□□□ 1.36
ACSS1-201ENST00000323482 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACSS1-201ENST00000323482 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ACSS1-201ENST00000323482 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.43■■□□□ 1.34
ACSS1-201ENST00000323482 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ACSS1-201ENST00000323482 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
ACSS1-201ENST00000323482 NBR1Q14596 966 aa23.3■■□□□ 1.32
ACSS1-201ENST00000323482 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ACSS1-201ENST00000323482 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.28■■□□□ 1.32
ACSS1-201ENST00000323482 SMARCA2P51531 1590 aa23.26■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 GOLGA3Q08378 1498 aa23.24■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 SMARCA4P51532 1647 aa23.22■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 CLIP1P30622 1438 aa23.2■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ACSS1-201ENST00000323482 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ACSS1-201ENST00000323482 ANP32CO43423 234 aa23.13■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.13■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 EEA1Q15075 1411 aa23.13■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.09■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
ACSS1-201ENST00000323482 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.05■■□□□ 1.28
ACSS1-201ENST00000323482 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.02■■□□□ 1.28
ACSS1-201ENST00000323482 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.01■■□□□ 1.27
ACSS1-201ENST00000323482 P3H3Q8IVL6 736 aa22.98■■□□□ 1.27
ACSS1-201ENST00000323482 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ACSS1-201ENST00000323482 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.96■■□□□ 1.27
ACSS1-201ENST00000323482 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ACSS1-201ENST00000323482 SYNJ1O43426 1573 aa22.92■■□□□ 1.26
ACSS1-201ENST00000323482 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.92■■□□□ 1.26
ACSS1-201ENST00000323482 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
ACSS1-201ENST00000323482 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACSS1-201ENST00000323482 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.89■■□□□ 1.25
ACSS1-201ENST00000323482 MSH5O43196 834 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms