Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUF60Q9UHX1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PUF60Q9UHX1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUF60Q9UHX1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUF60Q9UHX1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUF60Q9UHX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUF60Q9UHX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUF60Q9UHX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUF60Q9UHX1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUF60Q9UHX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PUF60Q9UHX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PUF60Q9UHX1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUF60Q9UHX1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms