Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-220ENST00000567884 572 ntTSL 513.32□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-218ENST00000567243 550 ntTSL 512.42□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-216ENST00000526055 469 ntTSL 217.3■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 CXXC5-212ENST00000511457 810 ntTSL 315.45■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 CXXC5-205ENST00000503511 506 ntTSL 215.44■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 CXXC5-204ENST00000502716 900 ntTSL 214.53□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 SIK3-211ENST00000485363 764 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.45□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)7.69□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 320.84■□□□□ 0.937e-9■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.847e-9■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 TNRC6B-204ENST00000441751 415 ntTSL 514.69□□□□□ -0.067e-9■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 512.27□□□□□ -0.457e-9■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.897e-9■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 GABRG3-204ENST00000554696 774 ntTSL 37.88□□□□□ -1.157e-9■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.427e-9■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.587e-9■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 LARP1-208ENST00000518892 399 ntTSL 319.79■□□□□ 0.764e-9■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 55□□□□□ -1.614e-9■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.694e-10■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 PNPLA3-202ENST00000406117 1480 ntTSL 214.09□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP26-215ENST00000469396 513 ntTSL 510.72□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP26-214ENST00000469131 667 ntTSL 310.72□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP26-211ENST00000451259 527 ntTSL 59.19□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 PHF3-207ENST00000505138 612 ntTSL 35.88□□□□□ -1.471e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 RIPOR1-221ENST00000569253 1874 ntTSL 218.36■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 SLC38A10-206ENST00000540966 896 ntTSL 315.95■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 SLC38A10-211ENST00000576151 774 ntTSL 214.84□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 DLG4-208ENST00000489885 1894 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 417.72■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 TXLNG-201ENST00000380122 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 516.96■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-213ENST00000524895 401 ntTSL 414.49□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 512.92□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CYP27A1-204ENST00000466602 1210 ntTSL 221.52■■□□□ 1.046e-13■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.586e-13■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CYP27A1-205ENST00000494263 2566 ntTSL 216.98■□□□□ 0.316e-13■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CYP27A1-203ENST00000445971 903 ntTSL 516.67■□□□□ 0.266e-13■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 317.79■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-221ENST00000546293 702 ntTSL 316.28■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 PKP3-207ENST00000530695 441 ntTSL 516.09■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-218ENST00000543868 507 ntTSL 214.67□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 214.47□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-216ENST00000542596 699 ntTSL 513.92□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-220ENST00000544958 473 ntTSL 313.16□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.323e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-208ENST00000609870 1549 ntTSL 212.69□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 512.13□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-214ENST00000633200 1496 ntTSL 211.89□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 WDR83OS-202ENST00000596731 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-210ENST00000631816 1803 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 ARAP1-213ENST00000536993 315 ntTSL 210.57□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-202ENST00000399850 7085 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 WDR83OS-201ENST00000222190 599 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 UBB-205ENST00000577640 724 ntTSL 59.89□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-207ENST00000609692 2210 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-201ENST00000354897 1754 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.912e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.914e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.954e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-205ENST00000542579 7982 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-215ENST00000636488 3908 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.994e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-212ENST00000632728 3827 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CUL3-208ENST00000454323 688 ntTSL 37.39□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 CUL3-212ENST00000497715 2400 ntTSL 25.03□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-215ENST00000512098 566 ntTSL 512.23□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 28.3
CSTF2TQ9H0L4 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.543e-8■■■■■ 28.2
CSTF2TQ9H0L4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 28.2
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